More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3383 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  61.11 
 
 
592 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  61.78 
 
 
592 aa  716    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  59.02 
 
 
592 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  100 
 
 
593 aa  1169    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  66.72 
 
 
592 aa  775    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  67.83 
 
 
599 aa  734    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  58.85 
 
 
592 aa  721    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  61.62 
 
 
592 aa  713    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  59.02 
 
 
592 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  44.23 
 
 
596 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  42.98 
 
 
596 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  41.93 
 
 
599 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  39.15 
 
 
598 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  35.31 
 
 
624 aa  347  4e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
588 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  35.03 
 
 
589 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.02 
 
 
588 aa  317  6e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  35.13 
 
 
622 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  31.93 
 
 
596 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.76 
 
 
596 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  33.22 
 
 
589 aa  306  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  36.93 
 
 
591 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.76 
 
 
623 aa  299  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  31.94 
 
 
597 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.49 
 
 
607 aa  296  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.09 
 
 
602 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.26 
 
 
596 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  34.1 
 
 
613 aa  291  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.61 
 
 
612 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 
608 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  32.11 
 
 
609 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.91 
 
 
588 aa  284  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.31 
 
 
593 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  33.5 
 
 
609 aa  282  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.74 
 
 
605 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.03 
 
 
588 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  31.23 
 
 
605 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33.79 
 
 
592 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.86 
 
 
627 aa  276  8e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.86 
 
 
618 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.95 
 
 
616 aa  272  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  33 
 
 
613 aa  272  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.36 
 
 
601 aa  271  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.38 
 
 
588 aa  269  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.63 
 
 
587 aa  269  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  33.84 
 
 
588 aa  266  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.99 
 
 
592 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.26 
 
 
605 aa  260  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  34.13 
 
 
581 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 
588 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.93 
 
 
614 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.02 
 
 
606 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.31 
 
 
619 aa  249  9e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 
605 aa  249  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  30.32 
 
 
591 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 
619 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  32.48 
 
 
606 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  30.19 
 
 
602 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.99 
 
 
609 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  31.53 
 
 
579 aa  242  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  31.14 
 
 
621 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.8 
 
 
602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.68 
 
 
602 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.78 
 
 
591 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  27.77 
 
 
588 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  29.84 
 
 
602 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  31.72 
 
 
609 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  28.83 
 
 
632 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.27 
 
 
609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.38 
 
 
641 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  31.72 
 
 
609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  33.09 
 
 
634 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  29.76 
 
 
590 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  30.56 
 
 
590 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.55 
 
 
594 aa  231  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  28.71 
 
 
588 aa  230  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  29.29 
 
 
590 aa  230  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  30.1 
 
 
619 aa  229  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  30.08 
 
 
593 aa  229  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.63 
 
 
610 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 
618 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.89 
 
 
611 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.63 
 
 
610 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.93 
 
 
610 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.63 
 
 
630 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  29.56 
 
 
610 aa  227  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.85 
 
 
609 aa  227  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  30.8 
 
 
591 aa  226  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  30.55 
 
 
586 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  28.79 
 
 
609 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  31.31 
 
 
608 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  31.31 
 
 
608 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  31.31 
 
 
608 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  31.31 
 
 
608 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.06 
 
 
616 aa  224  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  31.31 
 
 
608 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 
590 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.31 
 
 
593 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.93 
 
 
610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.8 
 
 
610 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>