More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3381 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  100 
 
 
591 aa  1146    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  74.37 
 
 
592 aa  789    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  73.06 
 
 
591 aa  780    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  51.76 
 
 
590 aa  595  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  42.31 
 
 
593 aa  462  1e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  42.3 
 
 
593 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  41.58 
 
 
594 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  42.67 
 
 
605 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  41.42 
 
 
632 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  42.64 
 
 
588 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  41.75 
 
 
606 aa  432  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  40.4 
 
 
593 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  39.97 
 
 
620 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  39.29 
 
 
641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  41.71 
 
 
614 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  37.35 
 
 
590 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  38 
 
 
590 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  40.57 
 
 
593 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  36.87 
 
 
588 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  36.82 
 
 
590 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  36.66 
 
 
588 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  36.15 
 
 
590 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  39.06 
 
 
591 aa  371  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 
591 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  36.59 
 
 
586 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  35.76 
 
 
619 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  36.26 
 
 
593 aa  359  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  38.66 
 
 
594 aa  351  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  35.7 
 
 
587 aa  339  8e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  35.71 
 
 
591 aa  329  8e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  37.25 
 
 
584 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  30.4 
 
 
588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.62 
 
 
602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.46 
 
 
596 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.14 
 
 
597 aa  263  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.71 
 
 
613 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  32.56 
 
 
623 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  30.56 
 
 
596 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  30.38 
 
 
596 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.16 
 
 
593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 
588 aa  243  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.11 
 
 
616 aa  243  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.85 
 
 
591 aa  239  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.54 
 
 
588 aa  238  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.38 
 
 
622 aa  238  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 
592 aa  237  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.15 
 
 
610 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.15 
 
 
630 aa  236  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 
592 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.98 
 
 
610 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  32.02 
 
 
588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.13 
 
 
609 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  29.95 
 
 
612 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.51 
 
 
581 aa  226  7e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 
608 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.19 
 
 
627 aa  225  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.34 
 
 
610 aa  224  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  29.16 
 
 
607 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  29.54 
 
 
598 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.57 
 
 
592 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.38 
 
 
618 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  28.33 
 
 
589 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  28.39 
 
 
592 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.76 
 
 
609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.8 
 
 
611 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.64 
 
 
609 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 
592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  29.69 
 
 
618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  28.38 
 
 
592 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  28.52 
 
 
588 aa  213  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  29.82 
 
 
605 aa  213  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  29.2 
 
 
600 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  28.16 
 
 
610 aa  212  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 
588 aa  211  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  29.24 
 
 
601 aa  207  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.52 
 
 
609 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30 
 
 
619 aa  207  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.52 
 
 
609 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.26 
 
 
589 aa  206  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.36 
 
 
620 aa  206  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  29.03 
 
 
610 aa  206  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  27.67 
 
 
591 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  27.8 
 
 
587 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.35 
 
 
609 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.69 
 
 
599 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  26.89 
 
 
613 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.68 
 
 
592 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.31 
 
 
610 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  29.84 
 
 
592 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  29.84 
 
 
592 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  29.84 
 
 
580 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  27.7 
 
 
609 aa  200  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  28.28 
 
 
599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  28.16 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  28.16 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  28.16 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.16 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  28.16 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.32 
 
 
610 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  30.3 
 
 
581 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>