More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3328 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
269 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.85 
 
 
271 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.41 
 
 
273 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  63.1 
 
 
273 aa  296  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.04 
 
 
273 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  60.08 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.52 
 
 
267 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.42 
 
 
293 aa  224  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.36 
 
 
274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.97 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.76 
 
 
268 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.53 
 
 
278 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.87 
 
 
274 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.35 
 
 
281 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.39 
 
 
301 aa  205  7e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.73 
 
 
273 aa  203  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 
280 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
271 aa  202  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
271 aa  202  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.21 
 
 
277 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.79 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 
273 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.79 
 
 
278 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.15 
 
 
269 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.39 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.82 
 
 
275 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.83 
 
 
277 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.06 
 
 
276 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.06 
 
 
277 aa  189  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.11 
 
 
275 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.11 
 
 
273 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.21 
 
 
272 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.98 
 
 
277 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.15 
 
 
277 aa  178  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 
275 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.03 
 
 
273 aa  171  9e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.67 
 
 
273 aa  168  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.28 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2416  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.83 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.31 
 
 
274 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.08 
 
 
273 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9249  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
300 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0562195  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0150  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  38.7 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000260384  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0212  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.81 
 
 
276 aa  152  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.13 
 
 
268 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0480  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 
272 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.904578 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
289 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
280 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.64 
 
 
289 aa  149  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.829406 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  35.61 
 
 
283 aa  149  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.935383  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3276  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.62 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215376  hitchhiker  0.00496059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.47 
 
 
274 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
269 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.11 
 
 
286 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.06 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.69 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.59 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.85 
 
 
273 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
275 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1627  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.66 
 
 
271 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00310738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2802  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 
278 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.26 
 
 
270 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
274 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 
280 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.3 
 
 
271 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
274 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.4 
 
 
264 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
282 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.12 
 
 
271 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.1 
 
 
274 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.27 
 
 
276 aa  142  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.13 
 
 
270 aa  142  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0660  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
271 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.26 
 
 
270 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.82 
 
 
274 aa  141  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2417  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 
271 aa  141  9e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3795  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.322832 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1136  pyrroline-5-carboxylate reductase  29.15 
 
 
272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0273851  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.72 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.33 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.99 
 
 
281 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1680  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 
289 aa  140  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.18 
 
 
270 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.98 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
279 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00667686 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.49 
 
 
277 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.29 
 
 
272 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2111  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
269 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.778537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.83 
 
 
277 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2306  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.82 
 
 
266 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000136167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.75 
 
 
276 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.14 
 
 
277 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.93 
 
 
271 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2684  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.55 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0759  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.09 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>