More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3319 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3319  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
218 aa  431  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00928337  normal  0.175337 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7154  penicillin-binding protein 1C  35.07 
 
 
692 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334526  normal  0.789669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  35.77 
 
 
731 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  31.25 
 
 
654 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  29.93 
 
 
662 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.35 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3058  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  28.74 
 
 
249 aa  58.9  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.317394  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 
793 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  27.83 
 
 
658 aa  58.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  30.34 
 
 
768 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6006  penicillin-binding protein 1C  34.33 
 
 
693 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
779 aa  58.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  33.33 
 
 
680 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 
752 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  29.93 
 
 
824 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  32.62 
 
 
724 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1679  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  27.92 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000648781  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  33.57 
 
 
755 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  33.58 
 
 
730 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  34.81 
 
 
706 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  34.31 
 
 
706 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  28.47 
 
 
791 aa  55.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  34.04 
 
 
724 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  34.04 
 
 
718 aa  55.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  26.42 
 
 
649 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0902  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  31.3 
 
 
240 aa  55.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1648  putative monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  28.38 
 
 
228 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.375739  hitchhiker  0.00248467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  31.82 
 
 
718 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04852  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  29.86 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1820  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
301 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.06 
 
 
646 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1883  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  26.28 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  30.67 
 
 
802 aa  55.1  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 
774 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1785  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
301 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0840  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  27.35 
 
 
244 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.199885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  30.83 
 
 
804 aa  55.1  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  27.03 
 
 
701 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0041  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
643 aa  54.7  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000612567  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1444  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  23.72 
 
 
495 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00309644  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  24.11 
 
 
642 aa  54.7  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  29.73 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  34.85 
 
 
696 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1041  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.68 
 
 
431 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  25.11 
 
 
827 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  34.23 
 
 
732 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  30.07 
 
 
727 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  30.08 
 
 
766 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3681  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  27.67 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  29.86 
 
 
704 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0041  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
643 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0770668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  32.12 
 
 
750 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  31.72 
 
 
691 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  26.09 
 
 
744 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  34.65 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  30.43 
 
 
680 aa  53.9  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  24.58 
 
 
841 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1172  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  26.58 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.82 
 
 
648 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  34.09 
 
 
750 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  28.57 
 
 
764 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3077  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  28.05 
 
 
261 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0895  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  28.05 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  28.57 
 
 
764 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  28.57 
 
 
764 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  32.12 
 
 
760 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  29.11 
 
 
823 aa  54.3  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0314  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
1011 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322795  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  28.57 
 
 
768 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  25.87 
 
 
774 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  31.76 
 
 
764 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  29.2 
 
 
693 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  25.87 
 
 
774 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  27.4 
 
 
683 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0858  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  28.05 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2935  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  29.05 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.137351  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
841 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  28.7 
 
 
844 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  28.7 
 
 
841 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
840 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  28.67 
 
 
769 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  30.18 
 
 
748 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1979  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  26.83 
 
 
275 aa  52.8  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00123405  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  36.17 
 
 
626 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1953  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
307 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.01 
 
 
668 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
844 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
844 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  29.32 
 
 
789 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
844 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
844 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2288  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  27.5 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
840 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  26.44 
 
 
796 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
840 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
840 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
840 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  28.7 
 
 
844 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  28 
 
 
797 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3657  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  27.81 
 
 
240 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>