35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3162 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  461  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  52.99 
 
 
236 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  55.07 
 
 
230 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  49.34 
 
 
230 aa  218  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  49.34 
 
 
230 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  48.92 
 
 
231 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  39.83 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  32.46 
 
 
227 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  35.81 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  36.17 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  37.93 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  34.78 
 
 
241 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  35.06 
 
 
235 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  34.35 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  31.78 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  36.42 
 
 
248 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  35.12 
 
 
250 aa  88.2  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  31.8 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  37.93 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  36.42 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  36.6 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  31.3 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  39.42 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  35.65 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  35.76 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  31.12 
 
 
251 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  36.18 
 
 
250 aa  81.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  33.48 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  34.34 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  35.84 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  34.36 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  33.53 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  32.9 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  33.71 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  31.53 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>