More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3034 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  100 
 
 
487 aa  959    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  45.36 
 
 
511 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 
456 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.89 
 
 
442 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  33.49 
 
 
438 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  33.49 
 
 
438 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  33.49 
 
 
438 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  33.49 
 
 
438 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  33.49 
 
 
438 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  33.49 
 
 
438 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  34.58 
 
 
430 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  33.49 
 
 
438 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  33.09 
 
 
437 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  30.24 
 
 
494 aa  186  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  32.78 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  32.89 
 
 
449 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  32.21 
 
 
449 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  30.67 
 
 
452 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  33.6 
 
 
460 aa  169  9e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  28.82 
 
 
469 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  31.08 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  32.2 
 
 
453 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  30.48 
 
 
413 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  26.74 
 
 
430 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  26.52 
 
 
429 aa  160  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  30.17 
 
 
443 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  31.27 
 
 
406 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  32.45 
 
 
493 aa  157  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  29.35 
 
 
432 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  29.66 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  33.33 
 
 
438 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  30.33 
 
 
433 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  30.33 
 
 
433 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  29.57 
 
 
433 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  30.45 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  29.29 
 
 
433 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  27.52 
 
 
447 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  29.49 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  29.43 
 
 
436 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  29.49 
 
 
434 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  29.49 
 
 
434 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  29.22 
 
 
434 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  28.1 
 
 
415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  28.34 
 
 
431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  30.52 
 
 
463 aa  130  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  28.08 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5419  hypothetical protein  30.5 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5578  hypothetical protein  30.62 
 
 
291 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  27.83 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  33.19 
 
 
293 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  31.98 
 
 
289 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  31.98 
 
 
289 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  26.96 
 
 
429 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  29.28 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  29.02 
 
 
414 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2553  hypothetical protein  33.8 
 
 
290 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00740521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3725  hypothetical protein  32.34 
 
 
273 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364927  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  31.45 
 
 
453 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1886  hypothetical protein  27.51 
 
 
594 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0804  hypothetical protein  26.97 
 
 
552 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0716  hypothetical protein  26.97 
 
 
552 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2089  hypothetical protein  26.97 
 
 
571 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0458657  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0732  hypothetical protein  26.76 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0245739  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0453  hypothetical protein  26.76 
 
 
571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2001  hypothetical protein  26.76 
 
 
552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66757  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  31.78 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1114  putative type VI secretion protein VasF  32.11 
 
 
275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1027  hypothetical protein  26.81 
 
 
560 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2521  hypothetical protein  27.31 
 
 
261 aa  107  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3247  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.36 
 
 
258 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1078  type IV / VI secretion system protein, DotU family  29.36 
 
 
258 aa  106  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  35.07 
 
 
489 aa  103  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  26.26 
 
 
410 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0993  OmpA/MotB family outer membrane protein  27.94 
 
 
404 aa  101  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0022  hypothetical protein  30.22 
 
 
257 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.828521  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3486  OmpA/MotB domain-containing protein  29.26 
 
 
404 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0632352  normal  0.779995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2799  type IV / VI secretion system protein, DotU family  27.16 
 
 
258 aa  100  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.514043  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0429  hypothetical protein  29.73 
 
 
257 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1758  IcmH  29.86 
 
 
257 aa  98.6  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  23.37 
 
 
536 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  23.37 
 
 
536 aa  97.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0321  hypothetical protein  29.13 
 
 
255 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0394  hypothetical protein  29.13 
 
 
255 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2952  hypothetical protein  23.37 
 
 
535 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.314306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2119  hypothetical protein  30.26 
 
 
289 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3923  DotU family type IV/VI secretion system protein  28.21 
 
 
405 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0053  hypothetical protein  27.91 
 
 
271 aa  94  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1514  type IV / VI secretion system protein, DotU family  32.48 
 
 
327 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568631  normal  0.950361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1204  hypothetical protein  27.09 
 
 
258 aa  92.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0809723  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2616  hypothetical protein  29.23 
 
 
289 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0188045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  32.33 
 
 
246 aa  91.3  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3232  hypothetical protein  27.98 
 
 
289 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2372  hypothetical protein  23.4 
 
 
282 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3385  hypothetical protein  23.95 
 
 
282 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373526  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  36.5 
 
 
330 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4081  hypothetical protein  30.3 
 
 
310 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  hitchhiker  0.000110004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  28.32 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0230  hypothetical protein  29.75 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05851  hypothetical protein  26.99 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  39.39 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>