47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3029 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  348  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  38.71 
 
 
169 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  35.29 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  33.11 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.26 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  35.5 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.97 
 
 
161 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  30.72 
 
 
160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  29.56 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.56 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  29.56 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  29.56 
 
 
161 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.81 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.07 
 
 
161 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  31.41 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  29.86 
 
 
154 aa  58.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  29.41 
 
 
161 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.44 
 
 
145 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  31.17 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.9 
 
 
171 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.25 
 
 
184 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.33 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  30.97 
 
 
159 aa  47.8  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  33.7 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  33.74 
 
 
167 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.63 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  33.83 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  30.25 
 
 
170 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  33.93 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  35.77 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  33.93 
 
 
182 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  33.93 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  33.93 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  29.19 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  29.19 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  33.93 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  33.93 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  33.93 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  30.61 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  30.61 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  30.67 
 
 
173 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>