74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2995 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  100 
 
 
348 aa  718    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0992  fatty acid desaturase  55.52 
 
 
317 aa  345  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  33.91 
 
 
351 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  38.97 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  37.08 
 
 
349 aa  165  9e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  36.14 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  36.01 
 
 
357 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  35.49 
 
 
354 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1030  fatty acid desaturase  34.98 
 
 
352 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  35.4 
 
 
349 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  37.33 
 
 
376 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0898  fatty acid desaturase  34.98 
 
 
353 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  32.14 
 
 
343 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  31.82 
 
 
343 aa  157  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  31.82 
 
 
319 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  31.82 
 
 
319 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  31.82 
 
 
343 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  32.36 
 
 
343 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  31.62 
 
 
343 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  34.66 
 
 
356 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  31.64 
 
 
343 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  31.44 
 
 
319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  30.75 
 
 
358 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  30.88 
 
 
343 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3212  fatty acid desaturase  30.75 
 
 
358 aa  146  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.19739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  33.33 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5160  fatty acid desaturase  33.23 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2618  fatty acid desaturase  26.9 
 
 
370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0196829  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3498  fatty acid desaturase  26.9 
 
 
370 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  27.86 
 
 
333 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14121  Fatty acid desaturase, type 2  26.95 
 
 
361 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15721  Fatty acid desaturase, type 2  23.64 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.768779  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15521  Fatty acid desaturase, type 2  25.66 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15871  Fatty acid desaturase, type 2  23.96 
 
 
368 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0618499  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1473  fatty acid desaturase, type 2  23.89 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0588239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2430  Fatty acid desaturase  24.74 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869864  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  24.62 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  24.62 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  25.56 
 
 
376 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  25.68 
 
 
352 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  23.7 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  25.34 
 
 
352 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0888  fatty acid desaturase  24.76 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458623  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4293  fatty acid desaturase  20.46 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.86551 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  26.05 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  25.72 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25 
 
 
376 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2776  fatty acid desaturase family protein  25.9 
 
 
424 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.758903  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.9 
 
 
410 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1727  fatty acid desaturase family protein  25.9 
 
 
424 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  25.9 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2875  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.9 
 
 
424 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2415  fatty acid desaturase family protein  25.9 
 
 
424 aa  54.3  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0599  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.9 
 
 
313 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3596  putative fatty acid desaturase  24.48 
 
 
364 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.843258  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  27.09 
 
 
454 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0284  fatty acid desaturase  32.08 
 
 
387 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  27.78 
 
 
330 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2878  fatty acid desaturase  21.76 
 
 
286 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.435135  normal  0.310027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1782  fatty acid desaturase family protein  28.71 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.412062 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  24.82 
 
 
435 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2941  fatty acid desaturase  29.03 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0374475  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  25.1 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  24.46 
 
 
352 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  24.36 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  24.48 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  22.11 
 
 
307 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  22.43 
 
 
359 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2363  fatty acid desaturase  22.05 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1351  fatty acid desaturase  29.7 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.223038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  23.02 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_3430  predicted protein  26.06 
 
 
400 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00816557  hitchhiker  0.0000371871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2577  fatty acid desaturase  23.25 
 
 
371 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.868766  normal  0.0327373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>