91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2958 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  60.23 
 
 
179 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 
190 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  36.63 
 
 
178 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  31.38 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.19 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  31.64 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  27.52 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  29.21 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  33.79 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.14 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.11 
 
 
185 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 
185 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 
185 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  30.36 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  28.39 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  27.54 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
220 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  26.22 
 
 
194 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  27.95 
 
 
204 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  26.11 
 
 
217 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  29.76 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  30.86 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  26.81 
 
 
213 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  30.22 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 
189 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  28.17 
 
 
174 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.33 
 
 
236 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 
180 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  24.09 
 
 
200 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.14 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  27.14 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  26.72 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.93 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  28.89 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  26.28 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 
859 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  27.45 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  23.94 
 
 
149 aa  47.8  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.76 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.43 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  22.38 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  26.76 
 
 
181 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  22.64 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  22.64 
 
 
188 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.15 
 
 
179 aa  45.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  24.68 
 
 
216 aa  45.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  25.93 
 
 
182 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.38 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.6 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.33 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.03 
 
 
180 aa  44.3  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  21.19 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  26.57 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  23.65 
 
 
191 aa  42  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  31.62 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.96 
 
 
176 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  24.55 
 
 
190 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  24.55 
 
 
190 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  27.65 
 
 
185 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  24.55 
 
 
190 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  29.71 
 
 
184 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  25.93 
 
 
186 aa  41.6  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  30.09 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  29.94 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  33 
 
 
173 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  24.49 
 
 
181 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>