42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2945 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2945  cupin 2 protein  100 
 
 
177 aa  357  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0664771  decreased coverage  0.00000748463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1620  cupin 2 domain-containing protein  39.41 
 
 
176 aa  138  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  41.95 
 
 
323 aa  129  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1112  cupin 2 protein  40.83 
 
 
340 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.792724  normal  0.152663 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4085  cupin 2 protein  40.34 
 
 
324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.362082 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02552  hypothetical protein  35.12 
 
 
334 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5036  cupin 2 domain-containing protein  31.76 
 
 
340 aa  90.9  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.484902  normal  0.704388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2810  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.67 
 
 
191 aa  88.2  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.597474  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3139  cupin domain protein  28.57 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.557804  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3109  cupin region  29.58 
 
 
175 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  32.59 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3171  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.17 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.480255  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0949  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3572  cupin region  30 
 
 
178 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140245  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3691  cupin 2, barrel  31.88 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.224723  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  33.33 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.86 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.86 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  30.71 
 
 
175 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  30.71 
 
 
175 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  30.71 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  30.71 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  31.43 
 
 
175 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  30.71 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3961  cupin 2 domain-containing protein  28.67 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  30.71 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  30.71 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  30.71 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  30.71 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  30.71 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  30.71 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  30.71 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  30.71 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  30.71 
 
 
175 aa  45.1  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  30.83 
 
 
129 aa  44.7  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  28.92 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  30.43 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0323  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.09 
 
 
175 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0947  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.05 
 
 
154 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>