13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2942 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2942  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000148294  decreased coverage  0.00000918436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2036  hypothetical protein  34.48 
 
 		 180 aa  84.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.316596  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2936  hypothetical protein  29.71 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0871  hypothetical protein  33.11 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0544539  normal  0.144695 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4204  hypothetical protein  30.3 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2903  hypothetical protein  31.3 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.700783  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0513  hypothetical protein  30.84 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0333  hypothetical protein  36.26 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3538  TRAP dicarboxylate family transporter DctQ subunit  27.34 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0964  hypothetical protein  29.32 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3018  C4-dicarboxylate transport system, small permease subunit  25.47 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000295646  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2186  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1304  Tripartite ATP-independent periplasmic transporter DctQ component  31.88 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.678951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>