More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2940 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2940  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  603  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0170064  decreased coverage  0.0000113665 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1743  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.854551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2051  transcriptional regulator, LysR family  28.91 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5891  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2188  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 329 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2070  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518674  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6676  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6666  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2079  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0843078  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1459  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2178  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1366  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.320453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  28.82 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5763  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  27.05 
 
 		 331 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2695  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3416  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1309  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3484  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.22 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.875325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3755  LysR substrate-binding  29.22 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6272  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0841  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 309 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.697299  normal  0.209982 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3085  LysR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2999  LysR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0222348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4227  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3833  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 312 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 329 aa  93.2  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3202  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.84 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5176  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5650  transcriptional regulator, LysR family  26.47 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1618  LysR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340872  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.16 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0989  LysR, substrate-binding  27.02 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.745768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3308  transcriptional regulator, LysR family  37.3 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3368  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.46 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.578087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4950  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 335 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3234  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.03 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.842433  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.75 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2923  nitrogen assimilation regulatory protein Nac, putative  28.07 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00510012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.75 
 
 		 299 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7296  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  0.377846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3051  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4861  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.71 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4677  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 343 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0483253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18090  transcriptional regulator, LysR family  38.92 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.502124  normal  0.864979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0879  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.388933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0464  transcriptional regulator, LysR family  26.23 
 
 		 316 aa  89.7  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0165  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3129  nitrogen assimilation transcriptional regulator  29.6 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.75 
 
 		 299 aa  89.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5879  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 299 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.927972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.75 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1478  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0854082  hitchhiker  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3568  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 307 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.318176  normal  0.117537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3766  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.763855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5219  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.73 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3631  LysR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.489296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2404  LysR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8569  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2034  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5968  transcriptional regulator, LysR family  26.57 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7661  transcriptional regulator LysR family  27.41 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3365  LysR substrate-binding  25.81 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.415783  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.34 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  26.34 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6151  transcriptional regulator, LysR family  26.78 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0798  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0269  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2830  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1909  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.52 
 
 		 334 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4037  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1282  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20294  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0795  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6344  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 310 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 292 aa  85.5  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0254  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.56957 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0274  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2145  DNA-binding transcriptional regulator CynR  25 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 307 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5255  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.294771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5029  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal  0.59636 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5372  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>