More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2840 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  100 
 
 
155 aa  312  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  56.38 
 
 
152 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  56.38 
 
 
152 aa  174  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  53.42 
 
 
161 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  56.03 
 
 
152 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  48.39 
 
 
155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  47.1 
 
 
155 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  53.64 
 
 
158 aa  160  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  52.45 
 
 
154 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  46.25 
 
 
159 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  45.16 
 
 
155 aa  150  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  42.58 
 
 
155 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  44 
 
 
150 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  38.51 
 
 
154 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  38.51 
 
 
156 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  38.51 
 
 
156 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  38.51 
 
 
154 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  41.43 
 
 
162 aa  123  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  39.86 
 
 
159 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  43.51 
 
 
159 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  40.6 
 
 
158 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  40.6 
 
 
158 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  43.28 
 
 
175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  45.45 
 
 
157 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  42.22 
 
 
157 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  38.85 
 
 
160 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  36.88 
 
 
163 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  35.67 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  37.31 
 
 
163 aa  103  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  39.71 
 
 
155 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  36.67 
 
 
185 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  34.69 
 
 
167 aa  100  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  36.3 
 
 
187 aa  97.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  35.51 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  35.14 
 
 
162 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  30.46 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  29.45 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  30.46 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  30.46 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  35.62 
 
 
179 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  29.8 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  30.61 
 
 
170 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  33.33 
 
 
163 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  31.88 
 
 
175 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  32.06 
 
 
174 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  31.91 
 
 
166 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  32.59 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  31.16 
 
 
171 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  31.16 
 
 
177 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  31.16 
 
 
171 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  31.16 
 
 
177 aa  94.4  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  31.16 
 
 
171 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  31.29 
 
 
171 aa  94  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0587  CheW protein  36.88 
 
 
174 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.647124  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.56 
 
 
174 aa  93.6  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4190  CheW protein  33.08 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  31.16 
 
 
178 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  31.16 
 
 
178 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.24 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  29.33 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.37 
 
 
183 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0157  chemotaxis protein CheW  37.86 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.419633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  31.16 
 
 
174 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0205  chemotaxis signal transduction protein  38.57 
 
 
157 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  28.76 
 
 
170 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  31.72 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  33.1 
 
 
218 aa  92  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  28.76 
 
 
170 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  34.69 
 
 
183 aa  92  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
175 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
175 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
175 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
175 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
175 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  29.25 
 
 
170 aa  91.7  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
175 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
175 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  31.82 
 
 
170 aa  91.3  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  30.15 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  29.93 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.11 
 
 
164 aa  90.1  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  31.16 
 
 
175 aa  90.5  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3789  CheW protein  31.16 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.763569  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  31.54 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3063  CheW protein  31.16 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  31.11 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  30.34 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  29.79 
 
 
163 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2416  chemotaxis protein CheW  35.82 
 
 
166 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261623  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  31.54 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  29.63 
 
 
160 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  36 
 
 
518 aa  88.6  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  31.54 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  30.6 
 
 
187 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  37.16 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5609  CheW protein  28.57 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.408217  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  32.64 
 
 
161 aa  87.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1611  CheW protein  37.8 
 
 
141 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00323467  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  29.66 
 
 
164 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  30.5 
 
 
174 aa  87  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>