More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2832 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  100 
 
 
244 aa  492  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  65.56 
 
 
245 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  55.92 
 
 
245 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  53.94 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  53.11 
 
 
270 aa  250  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  49.58 
 
 
243 aa  247  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  48.33 
 
 
243 aa  241  6e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  51.65 
 
 
249 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 
243 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  48.58 
 
 
248 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 
246 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 
246 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
246 aa  185  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
245 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 
251 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 
246 aa  174  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  38.93 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 
246 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 
245 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
254 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  39.29 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  37.8 
 
 
247 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
257 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
249 aa  141  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  39.51 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
255 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  39.92 
 
 
249 aa  134  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
254 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
241 aa  126  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
256 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
256 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  35.46 
 
 
256 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
244 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 
256 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
249 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
252 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  35.66 
 
 
254 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
260 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
260 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
245 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
249 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.786749  normal  0.588294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  35.39 
 
 
255 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
250 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1759  hypothetical protein  28.16 
 
 
240 aa  102  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1759  hypothetical protein  28.16 
 
 
240 aa  102  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 
260 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2291  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.448302  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3288  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3273  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0537  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.618923  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2168  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46714  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3237  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.94 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.85457  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4895  short chain dehydrogenase  30.12 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000739396  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  28.4 
 
 
261 aa  88.6  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
247 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3487  short chain dehydrogenase  28.86 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4129  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 
270 aa  85.5  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
242 aa  85.5  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3806  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 
260 aa  85.5  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0134  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6048  short chain dehydrogenase  29.39 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2904  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000166666  decreased coverage  0.000436169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3307  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0864591  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4782  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 
264 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0151  short chain dehydrogenase  30.17 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0142  short chain dehydrogenase  30.4 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0396452 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.13 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2785  short chain dehydrogenase  30.42 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0286  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.98 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000668025  hitchhiker  0.00000185563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3014  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.02 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.698047  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  33.18 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01815  short chain dehydrogenase  28.77 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  31.75 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4248  short chain dehydrogenase  27.95 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.53 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00978147  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>