225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2802 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1980  LamB/YcsF family protein  62.55 
 
 
259 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171805  normal  0.0279771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  52.78 
 
 
255 aa  249  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 
254 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
255 aa  244  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  49.6 
 
 
256 aa  238  6e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 
254 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 
251 aa  234  1e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3140  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 
258 aa  234  1e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3352  LamB/YcsF family protein  54.22 
 
 
253 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  48.81 
 
 
255 aa  232  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  49 
 
 
260 aa  231  7e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
255 aa  231  8e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  50 
 
 
252 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  52.61 
 
 
257 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 
254 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 
255 aa  229  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 
254 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  46.25 
 
 
256 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  48.21 
 
 
254 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
254 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 
254 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
249 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  47.39 
 
 
252 aa  227  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 
258 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  48.79 
 
 
260 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 
249 aa  222  5e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  47.2 
 
 
255 aa  221  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  47.18 
 
 
254 aa  221  9e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  45.7 
 
 
256 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  43.36 
 
 
257 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 
274 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 
254 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  46 
 
 
254 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  45.85 
 
 
256 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 
256 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  45.56 
 
 
251 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
304 aa  213  2e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 
255 aa  213  3e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
255 aa  212  5e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 
254 aa  211  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1497  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 
251 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258316  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  42.4 
 
 
257 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 
255 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 
255 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1386  LamB/YcsF family protein  48.83 
 
 
266 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.624042 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  44.08 
 
 
255 aa  209  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.21 
 
 
252 aa  209  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  45.9 
 
 
253 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 
255 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  45.45 
 
 
253 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
256 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  40.96 
 
 
250 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  46.99 
 
 
252 aa  205  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 
257 aa  205  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 
254 aa  206  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 
255 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  47.22 
 
 
260 aa  205  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  47.58 
 
 
252 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 
299 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  1.26458e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  46.43 
 
 
254 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2026  LamB/YcsF family protein  44.44 
 
 
256 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0388826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
247 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  43.55 
 
 
264 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2055  LamB/YcsF family protein  43.25 
 
 
257 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
246 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
256 aa  201  1e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 
250 aa  200  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 
250 aa  200  2e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  46.22 
 
 
256 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 
258 aa  199  4e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  45.49 
 
 
250 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 
250 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6367  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 
255 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.826752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  45.6 
 
 
252 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  41.94 
 
 
254 aa  198  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  47.01 
 
 
255 aa  198  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  44.27 
 
 
253 aa  198  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2131  LamB/YcsF family protein  51.98 
 
 
260 aa  197  1e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  46.28 
 
 
260 aa  198  1e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1504  LamB/YcsF family protein  47.93 
 
 
262 aa  197  2e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  42.86 
 
 
256 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1958  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
252 aa  196  5e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.289074  hitchhiker  0.00226482 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4552  LamB/YcsF family protein  43.51 
 
 
255 aa  195  5e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.152048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  43.95 
 
 
250 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  40.87 
 
 
252 aa  195  8e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
249 aa  195  8e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  43.15 
 
 
246 aa  194  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
255 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
301 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  40.24 
 
 
252 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  42.74 
 
 
246 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  40.16 
 
 
255 aa  193  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 
250 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  45.2 
 
 
250 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  44.76 
 
 
250 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  39.68 
 
 
253 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7659  LamB/YcsF family protein  39.92 
 
 
255 aa  191  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  39.36 
 
 
247 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  39.27 
 
 
253 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>