52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2734 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2734  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
585 aa  1165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.99 
 
 
596 aa  469  1e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  45.79 
 
 
593 aa  468  1e-130  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2405  hypothetical protein  45.05 
 
 
576 aa  467  1e-130  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0566608  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.79 
 
 
593 aa  468  1e-130  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  46 
 
 
589 aa  466  1e-130  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0537  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.95 
 
 
412 aa  110  8e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.268147  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  23.19 
 
 
485 aa  89.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
403 aa  72  3e-11  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0365  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.26 
 
 
456 aa  68.2  4e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396847  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0047  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.48 
 
 
448 aa  67.4  8e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 
363 aa  66.6  1e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.09 
 
 
414 aa  65.1  3e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0214  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.41 
 
 
454 aa  63.2  1e-08  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.103118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0088  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  21.05 
 
 
448 aa  63.5  1e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 
337 aa  62.8  2e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.41 
 
 
513 aa  62  3e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  27.78 
 
 
855 aa  59.7  1e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1393  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.5 
 
 
491 aa  59.3  2e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.5 
 
 
500 aa  59.7  2e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.844138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1389  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.09 
 
 
484 aa  58.5  3e-07  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.63 
 
 
388 aa  58.5  3e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0618  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.34 
 
 
460 aa  57  1e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559119  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0075  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.22 
 
 
459 aa  55.8  2e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.542735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1737  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.63 
 
 
466 aa  53.9  9e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00165447  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  28.57 
 
 
397 aa  52.4  3e-05  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0529  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.36 
 
 
519 aa  51.6  4e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.52 
 
 
397 aa  51.6  4e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1880  hypothetical protein  38.36 
 
 
519 aa  51.6  4e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  33.33 
 
 
401 aa  51.2  5e-05  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.02 
 
 
379 aa  50.8  7e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0039  hypothetical protein  22.49 
 
 
447 aa  50.4  8e-05  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.304092  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4612  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.28 
 
 
244 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3878  hypothetical protein  40.85 
 
 
178 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3279  antifreeze protein, type I  42.11 
 
 
178 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3594  antifreeze protein, type I  42.11 
 
 
178 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.742366  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0894  peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.21 
 
 
457 aa  48.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  32.41 
 
 
393 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  29 
 
 
394 aa  47.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.86 
 
 
364 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  24.65 
 
 
406 aa  47.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  40 
 
 
486 aa  47.4  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  3.82948e-09  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.47 
 
 
399 aa  45.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  22.91 
 
 
406 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  28.42 
 
 
395 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 
394 aa  44.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  28.42 
 
 
395 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  28.42 
 
 
395 aa  44.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  37.74 
 
 
270 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0134  peptidoglycan binding domain-containing protein  42 
 
 
450 aa  43.9  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  29.08 
 
 
497 aa  43.5  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  29.38 
 
 
394 aa  43.5  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>