162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2665 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2665  putative mRNA 3-end processing factor  100 
 
 		 335 aa  684    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14848 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1568  RNA procession exonuclease-like protein  68.48 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.359999 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2414  hypothetical protein  67.27 
 
 		 383 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1077  putative mRNA 3-end processing factor  67.27 
 
 		 383 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2587  hypothetical protein  69.11 
 
 		 342 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0305  putative mRNA 3-end processing factor  60.94 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0374  putative mRNA 3-end processing factor  59.45 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3043  putative mRNA 3-end processing factor  61.51 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0285628  normal  0.582199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4860  putative mRNA 3-end processing factor  60.62 
 
 		 375 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0310  putative mRNA 3-end processing factor  60 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.169646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3523  RNA procession exonuclease  53.45 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3335  RNA procession exonuclease  53.25 
 
 		 383 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2916  mRNA 3'-end processing factor  54.29 
 
 		 362 aa  356  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1582  RNA procession exonuclease-like protein  58.15 
 
 		 332 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4134  hypothetical protein  55.59 
 
 		 348 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02275  hypothetical protein  47.18 
 
 		 347 aa  339  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3872  hypothetical protein  54.97 
 
 		 348 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1754  RNA procession exonuclease-like protein  49.85 
 
 		 351 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5293  putative exonuclease involved in mRNA processing  54.05 
 
 		 382 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2561  putative mRNA 3-end processing factor  46.81 
 
 		 332 aa  324  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6856  hypothetical protein  48.62 
 
 		 340 aa  323  2e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.166328 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1106  RNA processing exonuclease  56.79 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.599734 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2196  RNA procession exonuclease-like protein  56.52 
 
 		 335 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  hitchhiker  0.00381998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1146  RNA procession exonuclease-like protein  56.79 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1135  RNA procession exonuclease-like protein  56.19 
 
 		 338 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4306  RNA procession exonuclease-like protein  56.17 
 
 		 338 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3896  hypothetical protein  51.03 
 
 		 368 aa  319  5e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170406  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1212  hypothetical protein  55.42 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1519  hypothetical protein  54.66 
 
 		 340 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1314  putative exonuclease involved in mRNA processing  53.31 
 
 		 383 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0772701  normal  0.174474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2959  mRNA 3'-end processing factor  51.1 
 
 		 332 aa  316  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.624115  hitchhiker  0.0000489273 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4681  putative exonuclease involved in mRNA processing  54.35 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  0.0823984 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1042  exonuclease  50.45 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01738  mRNA 3'-end processing factor  52.66 
 
 		 340 aa  296  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1460  exonuclease involved in mRNA processing  50 
 
 		 328 aa  288  9e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.562175  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07841  beta-lactamase fold exonuclease  37.38 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4616  putative mRNA 3-end processing factor  45.05 
 
 		 351 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1072  putative mRNA 3-end processing factor  45.62 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0686869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0552  hypothetical protein  45.37 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0871  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  45.35 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0794  putative mRNA 3-end processing factor  45.51 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0799  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase  46.82 
 
 		 348 aa  252  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.0112138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1471  putative mRNA 3-end processing factor  42.94 
 
 		 348 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07841  RNA processing exonuclease  36.42 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0750  putative mRNA 3-end processing factor  44.85 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0734  hypothetical protein  36.1 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0260  putative mRNA 3-end processing factor  44.51 
 
 		 344 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3560  putative mRNA 3-end processing factor  42.42 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.146642  normal  0.26456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3236  putative mRNA 3-end processing factor  42.42 
 
 		 352 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08581  RNA processing exonuclease  33.95 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0814782  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3431  putative mRNA 3-end processing factor  42.42 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1540  putative mRNA 3-end processing factor  42.95 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0150  exonuclease of the beta-lactamase fold involved in RNA processing-like protein  40.31 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0629  putative mRNA 3-end processing factor  42.95 
 
 		 365 aa  232  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.88354  decreased coverage  0.00579405 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0461  hypothetical protein  44.79 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3692  putative mRNA 3-end processing factor  42.42 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2803  putative mRNA 3-end processing factor  43.17 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.196277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3978  RNA procession exonuclease-like protein  42.42 
 
 		 371 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107304  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4043  putative mRNA 3-end processing factor  43.21 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0801  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  40.76 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.157265 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0913  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  41.08 
 
 		 336 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.228952 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0411  putative exonuclease protein involved in mRNA processing  41.1 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0031  putative mRNA 3-end processing factor  42.06 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.321442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4896  putative mRNA 3-end processing factor  40.82 
 
 		 335 aa  218  8.999999999999998e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0289  putative mRNA 3-end processing factor  42.68 
 
 		 337 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00669  RNA procession exonuclease-like protein  37.61 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6008  hypothetical protein  41.05 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0067  putative mRNA 3-end processing factor  42.3 
 
 		 357 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1612  RNA procession exonuclease-like protein  38.07 
 
 		 354 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3148  DNA ligase I, ATP-dependent Dnl1  30.97 
 
 		 1017 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331414  normal  0.459978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1406  RNA procession exonuclease-like protein  30.49 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0847473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0072  putative mRNA 3'-end processing factor  33.66 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0055  putative mRNA 3'-end processing factor  33.66 
 
 		 330 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0060  putative mRNA 3'-end processing factor  33.66 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0057  putative mRNA 3'-end processing factor  34.21 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251824 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1113  hypothetical protein  25.23 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.704257 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  27.08 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  28.53 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  29.88 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0149  RNA procession exonuclease-like protein  24.41 
 
 		 327 aa  79.3  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0104249 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00990  Endoribonuclease ysh1 (EC 3.1.27.-)(mRNA 3'-end-processing protein ysh1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BEP0]  33.33 
 
 		 884 aa  62.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0621  beta-lactamase domain-containing protein  22.9 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  23.36 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  29.36 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0788  putative mRNA 3-end processing factor  24.05 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.98 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  33.88 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  34.15 
 
 		 793 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  24.24 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1852  putative mRNA 3-end processing factor  27.36 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.681251  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  29.79 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 		 411 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  27.59 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  30.08 
 
 		 636 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0265  putative metallo-beta-lactamase  29.41 
 
 		 484 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 		 646 aa  53.5  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  29.61 
 
 		 454 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>