74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2651 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
165 aa  339  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  76.36 
 
 
165 aa  270  7e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  70.91 
 
 
165 aa  254  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  70.91 
 
 
169 aa  253  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  70.91 
 
 
165 aa  253  9e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  72.73 
 
 
165 aa  250  7e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  61.39 
 
 
172 aa  213  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  59.63 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  64.14 
 
 
190 aa  198  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  58.33 
 
 
172 aa  196  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  58.33 
 
 
172 aa  196  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  60.38 
 
 
171 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  60.62 
 
 
170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  58.33 
 
 
172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 
170 aa  192  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  61.38 
 
 
171 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  60 
 
 
171 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  57.23 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  59.01 
 
 
171 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  59.75 
 
 
172 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  57.67 
 
 
171 aa  177  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
199 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
199 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
170 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 
171 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 
172 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 
172 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 
170 aa  174  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 
170 aa  174  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  57.86 
 
 
170 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  60.27 
 
 
170 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  59.31 
 
 
170 aa  164  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
189 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
186 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
144 aa  44.7  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 
157 aa  44.3  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  28.33 
 
 
144 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  28.33 
 
 
144 aa  44.3  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
153 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  30.92 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
340 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
159 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
326 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
340 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  36.51 
 
 
99 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
145 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  31.87 
 
 
171 aa  41.6  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.72 
 
 
349 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
349 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.89 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
347 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  28.83 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
151 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  27.94 
 
 
143 aa  40.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 
156 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  27.94 
 
 
143 aa  40.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  27.94 
 
 
143 aa  40.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>