25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2638 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2638  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  358  3e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0108071 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1417  protein of unknown function DUF1486  84.48 
 
 
174 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.289435  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1105  hypothetical protein  34.72 
 
 
319 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.154683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3702  hypothetical protein  33.8 
 
 
331 aa  75.1  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0491552  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02563  hypothetical protein  28.76 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2641  hypothetical protein  30.63 
 
 
332 aa  71.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.0276572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2241  hypothetical protein  30.95 
 
 
344 aa  64.7  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1360  protein of unknown function DUF1486  28.48 
 
 
345 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.602593 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2464  hypothetical protein  27.22 
 
 
338 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04814  hypothetical protein  26.32 
 
 
338 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  29.46 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0611  hypothetical protein  26.04 
 
 
338 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  32.05 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  32.22 
 
 
123 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  36.36 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0915  protein of unknown function DUF1486  40.43 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.282506  normal  0.0578966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1710  hypothetical protein  25.32 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.518536  normal  0.0462427 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  27.91 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3371  hypothetical protein  25 
 
 
133 aa  42.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.032421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1107  protein of unknown function DUF1486  27.33 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4678  protein of unknown function DUF1486  30.85 
 
 
141 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000675641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0931  hypothetical protein  28.05 
 
 
140 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0351  protein of unknown function DUF1486  25.53 
 
 
145 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3104  hypothetical protein  29.11 
 
 
85 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0633963  normal  0.35406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2975  hypothetical protein  30.38 
 
 
152 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.903707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>