More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2595 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  65.1 
 
 
511 aa  640  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  65.12 
 
 
516 aa  668  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  64.94 
 
 
511 aa  649  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  100 
 
 
537 aa  1072  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  70.93 
 
 
503 aa  708  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  74.16 
 
 
510 aa  738  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  64.9 
 
 
511 aa  637  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  59.15 
 
 
500 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  52.39 
 
 
535 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  48.81 
 
 
861 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2120  ABC transporter related  50.61 
 
 
505 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0246641  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  47.88 
 
 
505 aa  453  1e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  47.75 
 
 
499 aa  448  1e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  46.69 
 
 
505 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.45 
 
 
503 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  1.10391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  43.79 
 
 
497 aa  445  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  47 
 
 
508 aa  441  1e-122  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  48.09 
 
 
500 aa  440  1e-122  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  44.31 
 
 
508 aa  439  1e-122  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  46.14 
 
 
501 aa  441  1e-122  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  48.08 
 
 
498 aa  440  1e-122  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  44.27 
 
 
501 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  44 
 
 
501 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  44.22 
 
 
494 aa  436  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
504 aa  437  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
496 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  46.58 
 
 
519 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  43.53 
 
 
512 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  43.6 
 
 
501 aa  433  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.73 
 
 
520 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
501 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.8 
 
 
501 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  43.8 
 
 
501 aa  433  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  44.06 
 
 
501 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  43.8 
 
 
501 aa  433  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.8 
 
 
501 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  44.92 
 
 
497 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  46.84 
 
 
511 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
501 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  43.6 
 
 
501 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  45.36 
 
 
497 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  46.57 
 
 
514 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  44.67 
 
 
522 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  43.31 
 
 
504 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  46.57 
 
 
514 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.12 
 
 
515 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  46.57 
 
 
514 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  41.94 
 
 
501 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  43.41 
 
 
501 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  44.89 
 
 
521 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
516 aa  431  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.6 
 
 
501 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  45.34 
 
 
495 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  43.9 
 
 
501 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  9.93507e-07 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  44.22 
 
 
500 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
510 aa  427  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.14 
 
 
517 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  42.33 
 
 
516 aa  428  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  44.1 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  42.14 
 
 
516 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  43.69 
 
 
516 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.79 
 
 
503 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  43.83 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  47.05 
 
 
509 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  43.83 
 
 
524 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.19 
 
 
496 aa  423  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  43.74 
 
 
524 aa  424  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  45.27 
 
 
503 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  43.12 
 
 
511 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  42.14 
 
 
516 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  44.21 
 
 
513 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  41.94 
 
 
516 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  44.35 
 
 
506 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.69 
 
 
527 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  43.15 
 
 
513 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 
525 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  43.42 
 
 
524 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  42.8 
 
 
501 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.23 
 
 
518 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  42.89 
 
 
501 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  44.02 
 
 
507 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.02 
 
 
507 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.43 
 
 
499 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  43.09 
 
 
501 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.65 
 
 
516 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0437  ABC transporter related  45.09 
 
 
501 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  42.51 
 
 
515 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.49 
 
 
511 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.42 
 
 
506 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  43 
 
 
524 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.02 
 
 
507 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.87 
 
 
495 aa  418  1e-115  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  46.15 
 
 
516 aa  416  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  43.09 
 
 
501 aa  418  1e-115  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  43.09 
 
 
501 aa  416  1e-115  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  43.69 
 
 
509 aa  417  1e-115  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  41.9 
 
 
504 aa  418  1e-115  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.41 
 
 
501 aa  416  1e-115  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 
523 aa  418  1e-115  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  43.98 
 
 
506 aa  417  1e-115  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>