279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2399 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  100 
 
 
74 aa  152  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  56.52 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  54.93 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  50.7 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  50.7 
 
 
101 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  47.89 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  55.22 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  39.44 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  43.66 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  49.12 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  44.78 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  43.28 
 
 
75 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  42.03 
 
 
77 aa  62.8  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  44.78 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  56.6 
 
 
81 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  38.89 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  40.58 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  50 
 
 
74 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  42.62 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  42.62 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  50 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  41.79 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  43.33 
 
 
78 aa  60.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  41.79 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  38.89 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  40 
 
 
201 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  36.62 
 
 
76 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  38.89 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  39.06 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  38.89 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  40.3 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  38.89 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  38.89 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  38.89 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  38.89 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  47.17 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  38.89 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.67 
 
 
189 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  36.23 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  36.62 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  38.89 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  43.1 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  33.8 
 
 
81 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.32 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  44.64 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  35.62 
 
 
72 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  42.86 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  32.39 
 
 
189 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  40.58 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  55.1 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  44.44 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  47.17 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  36.99 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  45.21 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  30 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  35 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  47.17 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.62 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  38.71 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  45.1 
 
 
74 aa  55.1  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  47.69 
 
 
87 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  38.03 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  34.72 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  34.78 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  44.07 
 
 
110 aa  53.9  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  39.13 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  43.64 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  35.71 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 
79 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  44.44 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  58.33 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  36.62 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  35.21 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  39.06 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  41.67 
 
 
92 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  38.57 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3149  SirA family protein  42.59 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0259716 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  36.62 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  28.57 
 
 
78 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  33.8 
 
 
84 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  36.23 
 
 
76 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  39.06 
 
 
77 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  36.23 
 
 
76 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>