More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2358 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2358  SufBD  100 
 
 
430 aa  870  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1626  sufD  71.23 
 
 
427 aa  601  1e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1246  SufBD  69.77 
 
 
426 aa  568  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2359  SufBD protein  65.66 
 
 
427 aa  561  1e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.421889  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2091  SufBD protein  66.2 
 
 
427 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.781657 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3967  SufBD protein  58.35 
 
 
448 aa  451  1e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.835948  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3260  FeS assembly protein SufD  38.5 
 
 
437 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.854773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2838  FeS assembly protein SufD  36.34 
 
 
459 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0458271  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1662  FeS assembly protein SufD  36.56 
 
 
440 aa  224  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1269  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2571  FeS assembly protein SufD  40.24 
 
 
447 aa  222  1e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3311  FeS assembly protein SufD  39.67 
 
 
430 aa  222  1e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4467  FeS assembly protein SufD  37.29 
 
 
446 aa  215  1e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2270  FeS assembly protein SufD  38.58 
 
 
399 aa  214  2e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5929  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  37.59 
 
 
441 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1606  FeS assembly protein SufD  36.02 
 
 
448 aa  209  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0238755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5846  FeS assembly protein SufD  35.81 
 
 
439 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798373  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0100  FeS assembly protein SufD  34.87 
 
 
444 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.993052 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0086  FeS assembly protein SufD  34.32 
 
 
446 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902249  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2326  FeS assembly protein SufD  32.72 
 
 
441 aa  196  8e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2744  FeS assembly protein SufD  34.24 
 
 
437 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3968  sufD, needed for fhuF Fe-S center production/stability  35.42 
 
 
440 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2458  FeS assembly protein SufD  33.78 
 
 
437 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.833793  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3979  FeS assembly protein SufD  34.53 
 
 
440 aa  192  9e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557806  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0697  SufBD protein  34.62 
 
 
440 aa  190  3e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2991  FeS assembly protein SufD  34.71 
 
 
437 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4347  FeS assembly protein SufD  34.29 
 
 
440 aa  190  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.964279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4459  FeS assembly protein SufD  34.13 
 
 
440 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.2712 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5107  FeS assembly protein SufD  34.65 
 
 
439 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0193182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0174  FeS assembly protein SufD  30.29 
 
 
441 aa  183  4e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  9.08978e-08 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5779  FeS assembly protein SufD  30.39 
 
 
439 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3353  FeS assembly protein SufD  32.13 
 
 
439 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1180  FeS assembly protein SufD  29.78 
 
 
438 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1235  FeS assembly protein SufD  32.99 
 
 
445 aa  179  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0976  iron-regulated ABC transporter, membrane-spanning permease  31.82 
 
 
425 aa  179  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0537  FeS assembly protein SufD  33.87 
 
 
445 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0905  FeS assembly protein SufD  34.24 
 
 
437 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.915641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0698  FeS assembly protein SufD  31.77 
 
 
440 aa  166  6e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0990  FeS assembly protein SufD  32.6 
 
 
434 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2104  FeS assembly protein SufD  32.35 
 
 
424 aa  163  5e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.111297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0727  FeS assembly protein SufD  32.85 
 
 
441 aa  163  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1970  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.15 
 
 
423 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  8.06248e-08 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1469  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.51 
 
 
423 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.866432  normal  0.0690013 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2488  FeS assembly protein SufD  30.54 
 
 
446 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2024  FeS assembly protein SufD  32.15 
 
 
444 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.554026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1799  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.34 
 
 
423 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.024835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1485  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.85 
 
 
423 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.06713e-09 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1779  FeS assembly protein SufD  31.9 
 
 
422 aa  159  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.377637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1763  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.9 
 
 
423 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.182167  hitchhiker  3.15224e-05 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0581  FeS assembly protein SufD  28.67 
 
 
434 aa  159  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.19168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1897  FeS assembly protein SufD  31.6 
 
 
424 aa  159  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1237  FeS assembly protein SufD  30 
 
 
433 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3153  FeS assembly protein SufD  28.9 
 
 
428 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1862  FeS assembly protein SufD  31.24 
 
 
442 aa  157  5e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1416  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  30.46 
 
 
439 aa  156  5e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199083  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1504  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.61 
 
 
423 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.429921  hitchhiker  3.49756e-08 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3443  FeS assembly protein SufD  29.06 
 
 
451 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  hitchhiker  7.88125e-08 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3038  FeS assembly protein SufD  30.86 
 
 
436 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0292386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2182  FeS assembly protein SufD  30.05 
 
 
430 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00372384  hitchhiker  0.000585375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0891  FeS assembly protein SufD  32.75 
 
 
439 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1882  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.44 
 
 
423 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.077757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01640  hypothetical protein  29.78 
 
 
423 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000779694  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1950  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.78 
 
 
423 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0520002  hitchhiker  2.20398e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1897  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.78 
 
 
423 aa  151  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00143509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1762  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.78 
 
 
423 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0210181  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4271  FeS assembly protein SufD  30.41 
 
 
447 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.707837  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04460  FeS assembly protein SufD  27.17 
 
 
437 aa  150  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01650  component of SufBCD complex  29.78 
 
 
423 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2749  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  31.7 
 
 
448 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1515  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  29.78 
 
 
423 aa  150  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.252227  hitchhiker  4.29728e-06 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0654  hypothetical protein  29.74 
 
 
428 aa  150  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2447  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  30.96 
 
 
448 aa  149  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0918237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0895  FeS assembly protein SufD  32.17 
 
 
437 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2253  FeS assembly protein SufD  29.43 
 
 
425 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0845  FeS assembly protein SufD  32.41 
 
 
437 aa  149  1e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.431893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0998  FeS assembly protein SufD  31.37 
 
 
420 aa  149  1e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364227  normal  0.129171 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0638  hypothetical protein  29.38 
 
 
428 aa  148  1e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1961  FeS assembly protein SufD  28.95 
 
 
423 aa  148  2e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0846147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1506  FeS assembly protein SufD  25.95 
 
 
475 aa  148  2e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187123  normal  0.203513 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2395  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.71 
 
 
423 aa  148  2e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.087197  hitchhiker  0.000115041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1194  FeS assembly protein SufD  28.68 
 
 
426 aa  147  4e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0412715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0259  hypothetical protein  33.22 
 
 
447 aa  144  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1697  FeS assembly protein SufD  29.88 
 
 
430 aa  144  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3282  FeS assembly protein SufD  30.18 
 
 
467 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.136347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1318  SufBD protein  37.14 
 
 
342 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0362341  normal  0.436939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1897  FeS assembly protein SufD  31.8 
 
 
454 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01977  FeS assembly protein SufD  31.97 
 
 
420 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4357  FeS assembly protein SufD  29.85 
 
 
453 aa  136  6e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0812  FeS assembly protein SufD  26.92 
 
 
421 aa  135  1e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0156327  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1466  FeS assembly protein SufD  28.19 
 
 
425 aa  135  1e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.269271  normal  0.0505489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0426  FeS assembly protein SufD  28.21 
 
 
454 aa  135  2e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0927  FeS assembly protein SufD  29.48 
 
 
425 aa  135  2e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.859558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2591  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.47 
 
 
441 aa  134  2e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0933  hypothetical protein  30.05 
 
 
425 aa  134  2e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.478935  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1737  Iron-regulated ABC transporter permease protein SufD  29.83 
 
 
442 aa  135  2e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1850  cysteine desulfurase activator complex subunit SufD  28.47 
 
 
441 aa  134  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0513191  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1446  SufD  28.08 
 
 
426 aa  132  1e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1513  FeS assembly protein SufD  28.08 
 
 
426 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0727  FeS assembly protein SufD  28.92 
 
 
422 aa  130  4e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2916  SufBD protein  31.12 
 
 
360 aa  129  1e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4170  FeS assembly protein SufD  27.53 
 
 
445 aa  128  2e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>