More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2305 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  100 
 
 		 291 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  76.29 
 
 		 291 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  76.98 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  66.44 
 
 		 296 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  69.13 
 
 		 298 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  69.13 
 
 		 298 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  69.13 
 
 		 298 aa  362  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  58.69 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  56.39 
 
 		 308 aa  318  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  56.23 
 
 		 307 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  57.05 
 
 		 305 aa  315  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  55.05 
 
 		 307 aa  308  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  55.41 
 
 		 308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  54.1 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  52.19 
 
 		 292 aa  289  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  53.44 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  52 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  51.67 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  50.85 
 
 		 289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  51.47 
 
 		 307 aa  281  7.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  51.54 
 
 		 307 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  51.67 
 
 		 308 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  52.68 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  53.8 
 
 		 312 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  50.17 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.3 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  51.7 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  50.68 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  51.33 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  49.16 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  49.31 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  53.44 
 
 		 308 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  50.5 
 
 		 312 aa  264  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  50 
 
 		 283 aa  263  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  48.61 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 283 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  48.3 
 
 		 292 aa  256  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0239  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1089  elongation factor Ts  49.47 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0664105  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  48.97 
 
 		 283 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  52.23 
 
 		 294 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  49.33 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  52.78 
 
 		 301 aa  255  7e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0708  elongation factor Ts  46.88 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0168239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3789  elongation factor Ts  47.24 
 
 		 283 aa  252  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  49.19 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2150  elongation factor Ts  48.14 
 
 		 292 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0274457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2596  elongation factor Ts  49.65 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.526378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  47.12 
 
 		 292 aa  244  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1014  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140304  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2065  elongation factor Ts  47.12 
 
 		 292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.96 
 
 		 302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3434  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000483484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1067  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0055688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1102  elongation factor Ts  47.06 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.433956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.23 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  48.85 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3164  elongation factor Ts  46.58 
 
 		 285 aa  242  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.347737  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  49.32 
 
 		 293 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2975  translation elongation factor Ts  45.94 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  52.2 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  47.59 
 
 		 310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0942  elongation factor Ts  44.79 
 
 		 283 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1250  elongation factor Ts  45.23 
 
 		 290 aa  238  8e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3359  elongation factor Ts  45.67 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1535  translation elongation factor Ts  46.37 
 
 		 287 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  48.99 
 
 		 295 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  49.66 
 
 		 292 aa  237  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1344  elongation factor Ts  46.02 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.483596 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  48.66 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  48.66 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  50.34 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  48.66 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  48.66 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  48.66 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  48.66 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  48.66 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1592  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 287 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.767126  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4185  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1198  elongation factor Ts  45.39 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.14285  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  45.39 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  48.32 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1147  elongation factor Ts  45.42 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  50 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  48.63 
 
 		 294 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  50.33 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4081  elongation factor Ts  45.07 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>