More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2245 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
435 aa  865    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  70.86 
 
 
447 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  72.12 
 
 
416 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  69.29 
 
 
423 aa  551  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  70.5 
 
 
448 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  71.6 
 
 
415 aa  523  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  67.76 
 
 
435 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  58.21 
 
 
457 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  55.58 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  53.16 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  54.85 
 
 
441 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  55.47 
 
 
465 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  57.44 
 
 
474 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  54.39 
 
 
471 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  54.39 
 
 
471 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  57.45 
 
 
470 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  54.63 
 
 
471 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  53.03 
 
 
450 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  55.58 
 
 
466 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  53.41 
 
 
434 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  52.83 
 
 
469 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  53.4 
 
 
474 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  50.62 
 
 
457 aa  375  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  53.47 
 
 
471 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  53.75 
 
 
457 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  55.47 
 
 
446 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  56.14 
 
 
460 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  55.76 
 
 
490 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  55.32 
 
 
472 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  55.5 
 
 
472 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  53.87 
 
 
442 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  52.01 
 
 
459 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  54.43 
 
 
474 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.53 
 
 
418 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  53.28 
 
 
442 aa  364  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  55.35 
 
 
455 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  52.75 
 
 
435 aa  361  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  52.2 
 
 
461 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  51.56 
 
 
444 aa  359  6e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  50.84 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.61 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  51.58 
 
 
432 aa  342  7e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  47.41 
 
 
433 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  47.16 
 
 
433 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  50.9 
 
 
432 aa  315  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  46.67 
 
 
433 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  46.67 
 
 
433 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  46.67 
 
 
433 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  45.54 
 
 
433 aa  309  5e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  48.38 
 
 
445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  48.23 
 
 
421 aa  303  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  44.55 
 
 
432 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  46.72 
 
 
414 aa  299  8e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 
441 aa  298  1e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  46.46 
 
 
414 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  47.29 
 
 
441 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  44.07 
 
 
415 aa  296  5e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4941  GTP-binding protein HflX  46.02 
 
 
433 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4684  GTP-binding proten HflX  46.42 
 
 
433 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712247  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0573  GTP-binding protein, HSR1-related  46.02 
 
 
433 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.884333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  48.24 
 
 
440 aa  289  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  47.67 
 
 
417 aa  289  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07550  GTP-binding protein HflX  45.68 
 
 
433 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  43.67 
 
 
441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2631  GTP-binding protein HSR1-related  42.96 
 
 
429 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.315157  unclonable  0.00000000000608691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  45.26 
 
 
461 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0524  GTP-binding protein, HSR1-like  44.44 
 
 
433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227372  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  45.48 
 
 
428 aa  282  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0432  putative GTPase HflX  45.76 
 
 
426 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000150209  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  46.74 
 
 
454 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  46.74 
 
 
454 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3720  putative GTPase HflX  43.53 
 
 
426 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00523075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3797  putative GTPase HflX  45.48 
 
 
428 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0756965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0698  putative GTPase HflX  45.48 
 
 
428 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  44.59 
 
 
450 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  42.96 
 
 
489 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  45.33 
 
 
429 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  44.69 
 
 
444 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3652  putative GTPase HflX  45.48 
 
 
428 aa  280  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  42.96 
 
 
489 aa  280  4e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  42.86 
 
 
435 aa  280  5e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  42.36 
 
 
435 aa  280  5e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3918  putative GTPase HflX  43.28 
 
 
426 aa  280  5e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.240209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  44.66 
 
 
429 aa  279  8e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  45.04 
 
 
429 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3820  GTP-binding proten HflX  44.57 
 
 
426 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0373648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  44.59 
 
 
450 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  43.88 
 
 
442 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  43.69 
 
 
439 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  44.57 
 
 
426 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4415  putative GTPase HflX  44.57 
 
 
426 aa  276  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.446722  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04002  hypothetical protein  44.57 
 
 
426 aa  276  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.170688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  44.57 
 
 
426 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  42.61 
 
 
432 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  44.57 
 
 
426 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4644  putative GTPase HflX  44.57 
 
 
426 aa  276  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0602066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  44.57 
 
 
426 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4704  putative GTPase HflX  44.57 
 
 
426 aa  276  6e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0493  putative GTPase HflX  45.6 
 
 
433 aa  276  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0353897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3539  small GTP-binding protein  46.13 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0887499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>