48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2229 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2229  cytochrome c, class II  100 
 
 		 156 aa  317  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2868  cytochrome c  47.77 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1427  cytochrome c, class II  38.26 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466816  normal  0.0348813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2785  cytochrome c-554  37.58 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336484  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4700  cytochrome c, class II  38.46 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.311415  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2126  cytochrome c, class II  34.68 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0474  cytochrome c'  36 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0404  cytochrome c prime  32.35 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0474  cytochrome c, class II  34.39 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.731529  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2396  cytochrome c, class II  34.92 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00865436  normal  0.433653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0286  cytochrome c prime  34.42 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0933227  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0291  cytochrome c, class II  33.77 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000294803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0216  cytochrome c, class II  34.29 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1043  cytochrome c, class II  37.24 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1989  cytochrome c, class II  29.49 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.13994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2544  cytochrome c, class II  33.11 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02251  cytochrome c  29.45 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4496  cytochrome c prime  26.88 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2695  cytochrome c class II  31.71 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.618119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2799  cytochrome c'  25.64 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.340153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1277  cytochrome c, class II  32.35 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0600  cytochrome c, class II  31.82 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1340  cytochrome c prime  29.94 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000194758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1062  cytochrome c class II  28.8 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.251364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1625  cytochrome c, class II  29.19 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0269  cytochrome c, class II  28.57 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1236  cytochrome C-556  33.86 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3420  cytochrome c'  28.28 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1134  cytochrome c, class II  29.25 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1205  cytochrome c, class II  28.97 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000342907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1135  cytochrome c, class II  28.97 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000323618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0901  cytochrome c, class II  27.89 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1266  cytochrome c prime  25.52 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1300  cytochrome c prime  26.21 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000571925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0590  cytochrome c class II  27.64 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3090  cytochrome c prime  26.21 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000689857  normal  0.0144373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1223  cytochrome c, class II  26.21 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000308946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1267  cytochrome c class II  26.21 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2910  cytochrome c, class II  25.66 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.963403  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0462  cytochrome c'  24.67 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3283  cytochrome c, class II  29.68 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00438456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1075  cytochrome c, class II  25.38 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4420  cytochrome c, class II  27.83 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1171  cytochrome c, class II  23.57 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5606  cytochrome c, class II  29.37 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.325565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1614  cytochrome c, class II  25.16 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1106  cytochrome c, class II  25.32 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00108735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0242  cytochrome c, class II  25.17 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00183316  normal  0.94125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>