27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2225 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2225  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  758    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0551964  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1533  hypothetical protein  55.64 
 
 
379 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.796419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6073  hypothetical protein  52.52 
 
 
378 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1483  hypothetical protein  52.79 
 
 
378 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.496023 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1584  hypothetical protein  54.7 
 
 
374 aa  355  7.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16808  normal  0.0492806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1378  hypothetical protein  47.32 
 
 
384 aa  263  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1372  hypothetical protein  38.57 
 
 
348 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.396707  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0874  hypothetical protein  40.91 
 
 
272 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0473235  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0876  hypothetical protein  46.84 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.878861  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1289  hypothetical protein  41.14 
 
 
283 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2226  DNA replication initiation ATPase  44.3 
 
 
330 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000024836  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1941  hypothetical protein  42.14 
 
 
200 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0327741  normal  0.29252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1776  hypothetical protein  45.51 
 
 
213 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0182975  normal  0.0433353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2060  DNA replication initiation ATPase  44.38 
 
 
203 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3518  hypothetical protein  42.77 
 
 
198 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0072  hypothetical protein  46.67 
 
 
180 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0573  hypothetical protein  42.03 
 
 
264 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0572  hypothetical protein  42.03 
 
 
214 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2687  hypothetical protein  42.75 
 
 
263 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4956  hypothetical protein  35.69 
 
 
282 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1710  hypothetical protein  45.65 
 
 
188 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.385544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0468  hypothetical protein  33.59 
 
 
280 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486566  normal  0.218243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0505  hypothetical protein  40.24 
 
 
275 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0199064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0434  hypothetical protein  40.74 
 
 
280 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.953981 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1204  hypothetical protein  43.33 
 
 
237 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.843488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2069  hypothetical protein  43.48 
 
 
157 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0895  hypothetical protein  28.96 
 
 
237 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610672  normal  0.201664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>