More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2079 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2079  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 445 aa  900    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.172467  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0929  Glycine hydroxymethyltransferase  59.95 
 
 		 440 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.802509  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3351  Glycine hydroxymethyltransferase  40 
 
 		 445 aa  266  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3925  Glycine hydroxymethyltransferase  41.04 
 
 		 417 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.991608  decreased coverage  0.00651172 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0045  serine hydroxymethyltransferase  35.28 
 
 		 430 aa  237  3e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0231458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0346  serine hydroxymethyltransferase  32.3 
 
 		 431 aa  236  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1090  serine hydroxymethyltransferase  36.55 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1650  serine hydroxymethyltransferase  31.8 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278355  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1611  Glycine hydroxymethyltransferase  31.06 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0014  serine hydroxymethyltransferase  34.77 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0048  serine hydroxymethyltransferase  34.35 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0271  Glycine hydroxymethyltransferase  32.87 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0061  Glycine hydroxymethyltransferase  30.81 
 
 		 433 aa  190  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1046  serine hydroxymethyltransferase  31.41 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1793  serine hydroxymethyltransferase  31.59 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1727  serine hydroxymethyltransferase  35.28 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4649  serine hydroxymethyltransferase  34.7 
 
 		 434 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.863224  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3354  serine hydroxymethyltransferase  36.99 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0554425  normal  0.88347 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  31.79 
 
 		 422 aa  176  7e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2659  serine hydroxymethyltransferase  34.28 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.719136  normal  0.877467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2634  serine hydroxymethyltransferase  35.05 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  36.26 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2671  serine hydroxymethyltransferase  34.54 
 
 		 433 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.163758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0765  serine hydroxymethyltransferase  33.51 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1814  serine hydroxymethyltransferase  34.54 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2530  serine hydroxymethyltransferase  33.25 
 
 		 439 aa  171  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  32.83 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1468  serine hydroxymethyltransferase  31.89 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  32.96 
 
 		 424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  33.61 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0758  serine hydroxymethyltransferase  32.98 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  34.57 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3004  serine hydroxymethyltransferase  34.02 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.21133  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1035  serine hydroxymethyltransferase  32.62 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  35.49 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  30.86 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1610  serine hydroxymethyltransferase  33.8 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  34.23 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  34.23 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  35.21 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0629  serine hydroxymethyltransferase  33 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1225  serine hydroxymethyltransferase  33.77 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3366  serine hydroxymethyltransferase  32.08 
 
 		 434 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2106  serine hydroxymethyltransferase  32.48 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0828  serine hydroxymethyltransferase  32.48 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0740  serine hydroxymethyltransferase  32.48 
 
 		 424 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  35.71 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2113  serine hydroxymethyltransferase  35.15 
 
 		 424 aa  163  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1537  serine hydroxymethyltransferase  31.95 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  31.6 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  30.77 
 
 		 418 aa  162  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1868  serine hydroxymethyltransferase  32.01 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0821  serine hydroxymethyltransferase  32.85 
 
 		 431 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3956  serine hydroxymethyltransferase  32.41 
 
 		 434 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0471  serine hydroxymethyltransferase  31.78 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1979  serine hydroxymethyltransferase  31.78 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00954911  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1006  serine hydroxymethyltransferase  31.78 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3303  serine hydroxymethyltransferase  32.01 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3262  serine hydroxymethyltransferase  33.08 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0710  serine hydroxymethyltransferase  32.24 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3495  serine hydroxymethyltransferase  32.6 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3171  serine hydroxymethyltransferase  32.6 
 
 		 434 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0221  serine hydroxymethyltransferase  31.57 
 
 		 412 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  31.43 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2240  serine hydroxymethyltransferase  34.89 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.435156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  32.48 
 
 		 417 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0055  serine hydroxymethyltransferase  33.52 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0959  Glycine hydroxymethyltransferase  31.69 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.587194  normal  0.162631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1266  serine hydroxymethyltransferase  33.15 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0458809  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1585  serine hydroxymethyltransferase  31.48 
 
 		 424 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2938  serine hydroxymethyltransferase  32.66 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0256  serine hydroxymethyltransferase  29.56 
 
 		 411 aa  157  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.666958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4508  serine hydroxymethyltransferase  30.32 
 
 		 412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3546  serine hydroxymethyltransferase  33.33 
 
 		 424 aa  156  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  31.84 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  33.5 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0870  glycine hydroxymethyltransferase  36 
 
 		 424 aa  156  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2110  serine hydroxymethyltransferase  32.6 
 
 		 434 aa  156  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5022  serine hydroxymethyltransferase  33.79 
 
 		 424 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.903187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1177  serine hydroxymethyltransferase  32.88 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0289619  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3104  serine hydroxymethyltransferase  35.31 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.425727  decreased coverage  0.00549191 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  31.97 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  30.33 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  32.74 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0373  serine hydroxymethyltransferase  32.5 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.238829  normal  0.155765 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0796  serine hydroxymethyltransferase  31.66 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2311  Glycine hydroxymethyltransferase  30.36 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314902  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  30.12 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5297  serine hydroxymethyltransferase  34.79 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3404  serine hydroxymethyltransferase  34.79 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  34.25 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4497  serine hydroxymethyltransferase  33.79 
 
 		 424 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5063  serine hydroxymethyltransferase  31.59 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0644659  normal  0.0156096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  30.31 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  30.31 
 
 		 425 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3047  serine hydroxymethyltransferase  33.77 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.302237  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  33.06 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2910  glycine hydroxymethyltransferase  32.05 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  32.44 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>