More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2034 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 231 aa  89  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 242 aa  86.3  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  37.36 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  32.43 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  32.43 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0804  transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 242 aa  71.6  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 317 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 295 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  29.7 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 276 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 272 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0537  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  25.73 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  26.21 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05660  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3595  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  27.92 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  36.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  46.3 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>