95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1988 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1988  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332704  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1233  hypothetical protein  63.44 
 
 
95 aa  116  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.346444  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0599  hypothetical protein  64.44 
 
 
96 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.543167  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2371  hypothetical protein  63.44 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.762767  normal  0.447407 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2103  hypothetical protein  62.37 
 
 
96 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.40869  normal  0.72885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0450  hypothetical protein  62.37 
 
 
96 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1641  hypothetical protein  54.95 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825876  hitchhiker  0.000000345307 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1110  hypothetical protein  50.54 
 
 
96 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2669  hypothetical protein  52.17 
 
 
96 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0199077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2403  hypothetical protein  50.54 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.79558  normal  0.741886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1957  hypothetical protein  51.09 
 
 
97 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0569002  normal  0.325909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2093  hypothetical protein  48.91 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302469  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3445  hypothetical protein  50 
 
 
110 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2630  hypothetical protein  46.81 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.152361 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3239  hypothetical protein  48.91 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371902  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0684  hypothetical protein  44.68 
 
 
97 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3708  hypothetical protein  46.24 
 
 
98 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3539  hypothetical protein  43.01 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4587  protein of unknown function DUF1330  43.01 
 
 
95 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0345  hypothetical protein  41.94 
 
 
96 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0272597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4815  protein of unknown function DUF1330  42.55 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353052  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1937  hypothetical protein  47.83 
 
 
97 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0325431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4324  protein of unknown function DUF1330  41.94 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4723  hypothetical protein  43.01 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3703  hypothetical protein  42.55 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12428 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6118  hypothetical protein  42.22 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133615  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0358  hypothetical protein  42.86 
 
 
214 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0495198  normal  0.391408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1325  hypothetical protein  44.68 
 
 
96 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0785  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0196  hypothetical protein  41.49 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1754  hypothetical protein  43.01 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6432  hypothetical protein  43.01 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.386875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6409  protein of unknown function DUF1330  41.94 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0341  protein of unknown function DUF1330  38.95 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00521106  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2045  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0164673  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2129  hypothetical protein  37.63 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1707  hypothetical protein  36.17 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1519  protein of unknown function DUF1330  43.62 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.407227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0008  hypothetical protein  37.63 
 
 
94 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00922624  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0334  hypothetical protein  36.17 
 
 
100 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.255499  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7205  protein of unknown function DUF1330  38.71 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1800  protein of unknown function DUF1330  41.49 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472957  normal  0.250055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1521  hypothetical protein  41.49 
 
 
114 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.997326  normal  0.585973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1359  hypothetical protein  41.94 
 
 
103 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102563  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0913  protein of unknown function DUF1330  41.49 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1268  hypothetical protein  40.26 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253243  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0971  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127294  normal  0.0142522 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0338  hypothetical protein  37.78 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.418889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1090  hypothetical protein  37.23 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1789  hypothetical protein  37.78 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1007  protein of unknown function DUF1330  42.55 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1874  hypothetical protein  37.78 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.446386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1067  protein of unknown function DUF1330  37.89 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108805  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5107  hypothetical protein  38.95 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.496431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2189  protein of unknown function DUF1330  45.57 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.321653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2667  protein of unknown function DUF1330  35.79 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3445  protein of unknown function DUF1330  39.36 
 
 
96 aa  57.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3183  hypothetical protein  39.36 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.614337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1054  hypothetical protein  39.36 
 
 
96 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1128  hypothetical protein  36.84 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2304  hypothetical protein  37.23 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0386  hypothetical protein  34.74 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0958  hypothetical protein  35.96 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1378  hypothetical protein  35.96 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0421  hypothetical protein  35.96 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0434  hypothetical protein  34.74 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0223  hypothetical protein  35.96 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0195535  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4093  hypothetical protein  36.56 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2483  hypothetical protein  41.25 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4724  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0417  hypothetical protein  36.56 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2337  protein of unknown function DUF1330  35.48 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1042  hypothetical protein  35.29 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.797208  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06041  hypothetical protein  34.21 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.497862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1504  hypothetical protein  31.87 
 
 
127 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0722  protein of unknown function DUF1330  30.21 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5022  protein of unknown function DUF1330  35.87 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0320092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2285  hypothetical protein  31.52 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0613201  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3229  hypothetical protein  32.97 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6641  protein of unknown function DUF1330  31.08 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0939  hypothetical protein  31.88 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6612  hypothetical protein  36 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4055  hypothetical protein  34.41 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1859  hypothetical protein  32.97 
 
 
96 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000278867  normal  0.769812 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12241  hypothetical protein  30.34 
 
 
115 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2987  protein of unknown function DUF1330  37.5 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4211  protein of unknown function DUF1330  33.73 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2807  protein of unknown function DUF1330  31.58 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2191  protein of unknown function DUF1330  33.33 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5042  hypothetical protein  30.12 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.662041  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2076  hypothetical protein  29.35 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3616  hypothetical protein  33.68 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3722  hypothetical protein  34.85 
 
 
89 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104061  normal  0.935166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11881  hypothetical protein  34.21 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.22766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0040  protein of unknown function DUF1330  30.43 
 
 
95 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000083486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>