69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1977 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1977  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1445    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  39.13 
 
 
596 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  38.36 
 
 
599 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  36.68 
 
 
724 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0210  hypothetical protein  38.39 
 
 
476 aa  150  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1864  hypothetical protein  30.65 
 
 
682 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.837746  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  36.97 
 
 
994 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
1621 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
1779 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3125  Tetratricopeptide domain protein  36.39 
 
 
1141 aa  135  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2765  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 
1083 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 
1448 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
1711 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  33.12 
 
 
1544 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
1247 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  32.24 
 
 
1219 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0209  Tetratricopeptide domain protein  33.74 
 
 
552 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0381  TPR repeat-containing protein  36.82 
 
 
422 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2481  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
1321 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3607  hypothetical protein  34.88 
 
 
393 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.496069  normal  0.349432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2009  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 
1502 aa  91.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0574678  decreased coverage  0.000390887 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0707  hypothetical protein  33.77 
 
 
326 aa  87.8  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0855  hypothetical protein  33.77 
 
 
326 aa  87.8  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1254  hypothetical protein  32.87 
 
 
322 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1285  hypothetical protein  32.87 
 
 
322 aa  87.4  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.253608  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  29 
 
 
992 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0270  hypothetical protein  32.97 
 
 
560 aa  84  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0400509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2335  copper amine oxidase domain protein  27.48 
 
 
934 aa  84  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
1911 aa  84  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1816  hypothetical protein  33.02 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  33.46 
 
 
799 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3364  hypothetical protein  32.21 
 
 
325 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175832  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2345  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
1869 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.386383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0466  hypothetical protein  29.36 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447492  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3460  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.97 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
1363 aa  70.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3302  Tetratricopeptide domain protein  26.62 
 
 
982 aa  67.4  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.56 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1909  copper amine oxidase-like protein  26 
 
 
490 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0548415  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.19 
 
 
767 aa  65.1  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.42 
 
 
1238 aa  64.7  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0474  tetratricopeptide TPR_4  35.58 
 
 
405 aa  64.3  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4599  hypothetical protein  30.89 
 
 
325 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.934593  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3227  tetratricopeptide domain-containing protein  36.73 
 
 
412 aa  63.9  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3758  hypothetical protein  30.06 
 
 
337 aa  62.4  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
878 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2760  hypothetical protein  25.86 
 
 
445 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3867  hypothetical protein  27.84 
 
 
327 aa  60.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3221  hypothetical protein  31.75 
 
 
737 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3203  hypothetical protein  27.69 
 
 
332 aa  59.7  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  36.13 
 
 
672 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1908  copper amine oxidase-like protein  22.06 
 
 
962 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.510602  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
1105 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  31.98 
 
 
162 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2368  hypothetical protein  33.82 
 
 
426 aa  52  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.021674 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 
1476 aa  51.6  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  31.44 
 
 
1328 aa  51.2  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4791  hypothetical protein  33.33 
 
 
720 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2219  hypothetical protein  26.46 
 
 
720 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0983083 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07129  conserved hypothetical protein  36.09 
 
 
997 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242912  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
1215 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 
771 aa  46.6  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
444 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3883  hypothetical protein  30.32 
 
 
501 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.879407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3801  tetratricopeptide TPR_4  33.92 
 
 
425 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  29.72 
 
 
1039 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
481 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.43 
 
 
764 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.74 
 
 
1424 aa  43.9  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>