52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1962 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1962  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000465234  normal  0.472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1695  hypothetical protein  56.08 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305402  normal  0.0354214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1383  putative phytoene/squalene synthetase  50.98 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0024751  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1155  hypothetical protein  49 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0425779 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2725  phytoene/squalene synthetase  49.41 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.629616  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2074  phytoene/squalene synthetase-like protein  50.98 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14342  normal  0.219879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3040  putative phytoene synthase  31.88 
 
 		 281 aa  98.6  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1802  squalene/phytoene synthase  37.5 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.283074  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1759  putative phytoene synthase protein  39.02 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4061  hypothetical protein  48.19 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1180  phytoene/squalene synthetase-like protein  42.07 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1766  squalene/phytoene synthase  37.09 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567631  normal  0.0104629 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2858  Squalene/phytoene synthase  36 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0793384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2191  Squalene/phytoene synthase  39.39 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2494  squalene/phytoene synthase  39.53 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2279  squalene/phytoene synthase  38.1 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1004  squalene/phytoene synthase  30.74 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4744  Squalene/phytoene synthase  35.88 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0251048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4403  putative phytoene synthase (terpenoid synthase)  34.87 
 
 		 288 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617477  normal  0.124471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1176  putative phytoene synthase protein  34.13 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691183  normal  0.0670648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2774  phytoene synthase  35.12 
 
 		 288 aa  68.6  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_004310  BR0893  hypothetical protein  34.62 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0889  hypothetical protein  34.62 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2334  phytoene synthase  31.94 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1794  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0830515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3169  putative phytoene synthase  32.56 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1498  phytoene synthase protein  30.81 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.587215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1696  Squalene/phytoene synthase  30.23 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4225  squalene/phytoene synthase  35.88 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0742858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4595  Squalene/phytoene synthase  35.88 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0988127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2729  phytoene synthase  32.79 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.241637  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3104  hypothetical protein  37.1 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0665725  normal  0.469934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2656  phytoene synthase  32.14 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0526  hypothetical protein  23.98 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2773  phytoene synthase  35.77 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.186675 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4312  squalene/phytoene synthase  37.39 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0386  hypothetical protein  32.79 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200827  normal  0.576494 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00043  conserved hypothetical protein  25.14 
 
 		 392 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  28 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 276 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  25.99 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  27.49 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0577  squalene/phytoene synthase  42.86 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.576653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  26.58 
 
 		 307 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  26.58 
 
 		 307 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  26.58 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33756  predicted protein  25.87 
 
 		 711 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0254551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  26.58 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  26.58 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  26.42 
 
 		 293 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  26.37 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>