58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1961 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1961  methyltransferase type 12  100 
 
 
241 aa  474  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00015321  normal  0.48171 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2073  methyltransferase type 12  44.68 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.131474  normal  0.216691 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2724  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.34 
 
 
239 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1382  methyltransferase type 12  44.92 
 
 
239 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00680014  normal  0.829686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0889  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0190942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  38.43 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04067  SAM-dependent methyltransferase  32.22 
 
 
390 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2976  hypothetical protein  28.63 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3977  normal  0.29484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
254 aa  109  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0767  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
390 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
390 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  35.39 
 
 
464 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1585  hypothetical protein  29.58 
 
 
256 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1584  methyltransferase type 11  32.92 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0064  Methyltransferase type 11  33.86 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3419  methyltransferase type 11  29.55 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00381882 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1685  hypothetical protein  28.33 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
391 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0966  putative transcriptional regulator  28.19 
 
 
392 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0250  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
392 aa  89.4  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.757542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1075  hypothetical protein  29.47 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238827  normal  0.291334 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0350  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0585  methyltransferase type 11  28.11 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0938  MerR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7265  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.05 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5922  beta-ketoacyl synthase  31.47 
 
 
2021 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  30.39 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  35.9 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.833494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4173  hypothetical protein  26.75 
 
 
338 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0727  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.7 
 
 
406 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.560156  normal  0.551186 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
319 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  34.78 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  34.78 
 
 
280 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
199 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  27.44 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2291  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.34 
 
 
416 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38812  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  27.61 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.43 
 
 
196 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0542  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
321 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.95 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.02 
 
 
258 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
264 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 
572 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  35 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2937  methyltransferase type 12  27.81 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  28.05 
 
 
269 aa  42.4  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.61 
 
 
316 aa  42  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  31.25 
 
 
274 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
256 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  32.71 
 
 
251 aa  42  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2626  sun protein  46.34 
 
 
437 aa  41.6  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0106  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.64 
 
 
406 aa  41.6  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000308019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>