More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1944 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  100 
 
 
433 aa  890  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  69.84 
 
 
435 aa  621  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  3.45699e-05 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  69.44 
 
 
444 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  63.76 
 
 
440 aa  583  1e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  63.3 
 
 
440 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  63.47 
 
 
440 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  48.06 
 
 
443 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  43.75 
 
 
474 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  42.53 
 
 
446 aa  366  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  42.53 
 
 
446 aa  366  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  45.5 
 
 
458 aa  363  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  45.48 
 
 
453 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  45.96 
 
 
478 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  44.57 
 
 
457 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  45.18 
 
 
448 aa  355  6e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  44.09 
 
 
457 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  40.86 
 
 
471 aa  352  7e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  43.62 
 
 
444 aa  352  8e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  44.29 
 
 
456 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  43.29 
 
 
451 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  45.2 
 
 
484 aa  351  2e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  44.14 
 
 
474 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  42.19 
 
 
446 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  46.19 
 
 
478 aa  345  6e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  43.94 
 
 
467 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  43.46 
 
 
467 aa  343  3e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  43.97 
 
 
467 aa  342  6e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  43.35 
 
 
470 aa  340  3e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  40.75 
 
 
446 aa  338  9e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  44.44 
 
 
472 aa  338  1e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  44.65 
 
 
448 aa  338  1e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  42.86 
 
 
476 aa  338  1e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  44.44 
 
 
489 aa  338  2e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  40.81 
 
 
438 aa  337  3e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  43.72 
 
 
494 aa  336  4e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  44.93 
 
 
482 aa  336  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  43.26 
 
 
465 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  41.44 
 
 
439 aa  334  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  42.59 
 
 
450 aa  332  8e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  45.73 
 
 
453 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  42.66 
 
 
440 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  43.21 
 
 
462 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  43.45 
 
 
452 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  42.6 
 
 
463 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  43.72 
 
 
439 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  43.96 
 
 
468 aa  330  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  44.03 
 
 
466 aa  329  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  43.19 
 
 
443 aa  328  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  44.32 
 
 
457 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  43.39 
 
 
488 aa  327  3e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  43.72 
 
 
459 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  43.92 
 
 
458 aa  325  8e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  42.4 
 
 
463 aa  325  8e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  43.36 
 
 
455 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  42.49 
 
 
448 aa  323  4e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  42.35 
 
 
478 aa  322  6e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  46.03 
 
 
472 aa  322  9e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  44 
 
 
455 aa  322  1e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  42.69 
 
 
443 aa  321  2e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  40.75 
 
 
444 aa  321  2e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  45.01 
 
 
460 aa  319  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  37.33 
 
 
452 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  44.04 
 
 
463 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  42.38 
 
 
472 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  41.16 
 
 
446 aa  317  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  42.67 
 
 
468 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  41.47 
 
 
451 aa  316  7e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  40.09 
 
 
470 aa  315  1e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  43.17 
 
 
500 aa  315  1e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  41.01 
 
 
451 aa  315  1e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  40.78 
 
 
451 aa  315  1e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  40.78 
 
 
451 aa  314  2e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  43.52 
 
 
463 aa  313  3e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  41.79 
 
 
488 aa  313  3e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  44.47 
 
 
517 aa  313  3e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  42.83 
 
 
494 aa  312  7e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  43.26 
 
 
450 aa  312  8e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  45.45 
 
 
437 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  43.12 
 
 
447 aa  310  3e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  43.06 
 
 
436 aa  309  6e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  40.86 
 
 
443 aa  308  1e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  43.27 
 
 
466 aa  308  1e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  41.11 
 
 
453 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  40.05 
 
 
449 aa  306  5e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  43.69 
 
 
445 aa  303  4e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  40.56 
 
 
482 aa  303  4e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  41.04 
 
 
452 aa  303  5e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  39.82 
 
 
487 aa  303  5e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  40.55 
 
 
458 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  42.23 
 
 
474 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  39.06 
 
 
447 aa  299  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  40.65 
 
 
479 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  42.34 
 
 
457 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  41.41 
 
 
452 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  41.33 
 
 
470 aa  296  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  38.25 
 
 
453 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  38.15 
 
 
458 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  39.69 
 
 
479 aa  292  8e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  38.18 
 
 
450 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  38.54 
 
 
491 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>