44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1871 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1871  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0219449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2615  hypothetical protein  47.35 
 
 
322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1035  hypothetical protein  47.81 
 
 
365 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.138536  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1261  hypothetical protein  43.41 
 
 
335 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2013  hypothetical protein  42.91 
 
 
326 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.777902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1178  hypothetical protein  43.15 
 
 
328 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0102548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1864  protein of unknown function DUF1624  40.08 
 
 
329 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161953  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2067  protein of unknown function DUF1624  39.77 
 
 
329 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1137  hypothetical protein  43.52 
 
 
298 aa  145  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0118905  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4134  hypothetical protein  38.96 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2413  hypothetical protein  33.9 
 
 
258 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2737  hypothetical protein  43.5 
 
 
339 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.891818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1837  hypothetical protein  34.87 
 
 
258 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3231  protein of unknown function DUF1624  41.55 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.356551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3195  protein of unknown function DUF1624  41.44 
 
 
328 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.856715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3006  hypothetical protein  41.1 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.166518  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1829  hypothetical protein  36.33 
 
 
244 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.390473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1762  hypothetical protein  34.6 
 
 
243 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.175449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2952  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2032  protein of unknown function DUF1624  32.22 
 
 
256 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1672  hypothetical protein  32.22 
 
 
256 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1820  protein of unknown function DUF1624  32.81 
 
 
261 aa  99.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1538  hypothetical protein  30.74 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00890695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1883  protein of unknown function DUF1624  42.62 
 
 
334 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1683  hypothetical protein  31.95 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1385  hypothetical protein  26.5 
 
 
245 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0665  hypothetical protein  26.5 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.646627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1793  hypothetical protein  28.38 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2070  protein of unknown function DUF1624  28.87 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.250094  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00327  hypothetical protein  30.87 
 
 
232 aa  89  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0098  hypothetical protein  33.06 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1291  hypothetical protein  25.63 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.687522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1147  hypothetical protein  28.22 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0043  hypothetical protein  31.15 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0347  hypothetical protein  30 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000605459  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2995  hypothetical protein  29.71 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.961096  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0143  hypothetical protein  27.54 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0080  protein of unknown function DUF1624  27.57 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000683778  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0097  hypothetical protein  26.02 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0429  hypothetical protein  28.69 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000311918  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0771  protein of unknown function DUF1624  26.24 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.627513  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1588  hypothetical protein  23.95 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117869  hitchhiker  0.00161321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0380  hypothetical protein  43.68 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.421494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1589  hypothetical protein  25.6 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000654588  hitchhiker  0.00067208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>