41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1808 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1808  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1731  hypothetical protein  50.23 
 
 
203 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0545738  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6078  hypothetical protein  50.29 
 
 
275 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1550  hypothetical protein  50.29 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0360168  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0943  hypothetical protein  44 
 
 
236 aa  128  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0896  hypothetical protein  63 
 
 
262 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0019435  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1115  hypothetical protein  49.39 
 
 
249 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2997  hypothetical protein  52.94 
 
 
275 aa  81.6  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247811  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0648  hypothetical protein  46.88 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3522  hypothetical protein  60.34 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00855265  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3814  hypothetical protein  60.34 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2500  hypothetical protein  58.62 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  58.93 
 
 
401 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1908  hypothetical protein  52.7 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.344277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3953  hypothetical protein  54.1 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129497  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1016  hypothetical protein  57.35 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0988  hypothetical protein  50.59 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4586  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0140  hypothetical protein  49.43 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  0.0783474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0612  hypothetical protein  56.67 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1798  hypothetical protein  50 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1749  hypothetical protein  48.15 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116456  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0375  hypothetical protein  55 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579408  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0095  hypothetical protein  55 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0468  hypothetical protein  55 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0071  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.878621  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7607  hypothetical protein  55.17 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00689527  normal  0.216662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0510  hypothetical protein  55 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.0447134 
 
 
-
 
NC_004310  BR1865  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0953  hypothetical protein  50 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0203333  normal  0.0141438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  48.75 
 
 
425 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1038  hypothetical protein  50.82 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0341013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0916  hypothetical protein  52.24 
 
 
431 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  51.67 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0114  hypothetical protein  51.67 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  50.75 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0824  hypothetical protein  49.37 
 
 
345 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  46.15 
 
 
315 aa  68.6  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0247  hypothetical protein  51.72 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2528  hypothetical protein  30.69 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2712  hypothetical protein  42.11 
 
 
273 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0286  hypothetical protein  36.76 
 
 
340 aa  51.6  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>