160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1422 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1422  xylose isomerase-like  100 
 
 
297 aa  613  1e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0452084  normal  0.457038 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3346  xylose isomerase-like TIM barrel  78.45 
 
 
297 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0217845  normal  0.180586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1271  xylose isomerase domain protein TIM barrel  76.85 
 
 
298 aa  474  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2054  xylose isomerase domain-containing protein  36.16 
 
 
308 aa  231  9e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50250  hypothetical protein  37.79 
 
 
307 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3018  hypothetical protein  36.16 
 
 
307 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.130345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1048  Myo-inosose-2 dehydratase  34.53 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.513171  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1407  xylose isomerase domain-containing protein  35.18 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1247  putative myo-inositol catabolism protein  34.2 
 
 
313 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1886  xylose isomerase domain-containing protein  34.85 
 
 
308 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.206917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0947  xylose isomerase-like TIM barrel  34.53 
 
 
308 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1429  xylose isomerase domain-containing protein  34.53 
 
 
308 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1348  xylose isomerase domain-containing protein  35.18 
 
 
308 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1309  xylose isomerase domain-containing protein  34.85 
 
 
308 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4573  xylose isomerase-like TIM barrel  34.2 
 
 
308 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7455  hypothetical protein  36.39 
 
 
292 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0657  Myo-inosose-2 dehydratase  33.11 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4055  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  34.81 
 
 
297 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0386  xylose isomerase domain-containing protein  33.33 
 
 
306 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1696  Myo-inosose-2 dehydratase  32.57 
 
 
308 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1981  Myo-inosose-2 dehydratase  31.86 
 
 
301 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2746  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  32.07 
 
 
330 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0941  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.16 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0824  xylose isomerase domain-containing protein  31.86 
 
 
303 aa  151  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2490  xylose isomerase domain-containing protein  28.91 
 
 
303 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  normal  0.973607 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1521  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  31.65 
 
 
294 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1722  xylose isomerase-like TIM barrel  30.87 
 
 
299 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.688264  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0730  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.95 
 
 
295 aa  125  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200556  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3352  Myo-inosose-2 dehydratase  29.67 
 
 
296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0467219  normal  0.0568196 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0086  myo-inositol catabolism protein IolE  26.17 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0043  xylose isomerase domain-containing protein  28.85 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2612  xylose isomerase domain-containing protein  31.48 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4487  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.86 
 
 
289 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411638  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1362  Myo-inosose-2 dehydratase  29.84 
 
 
294 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1816  xylose isomerase domain-containing protein  31.85 
 
 
304 aa  109  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.670883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3273  AP endonuclease  29.51 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0853475  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3969  xylose isomerase domain-containing protein  30.65 
 
 
290 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0171269  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6852  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.54 
 
 
284 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3079  Myo-inosose-2 dehydratase  30.46 
 
 
287 aa  106  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977094  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1620  hypothetical protein  26.67 
 
 
298 aa  105  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0911  hypothetical protein  28.94 
 
 
306 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1442  AP endonuclease  28.94 
 
 
306 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0438  hypothetical protein  28.94 
 
 
306 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1653  AP endonuclease  28.94 
 
 
306 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0724  AP endonuclease  28.94 
 
 
306 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367793  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1615  hypothetical protein  26.33 
 
 
298 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5448  Myo-inosose-2 dehydratase  27.57 
 
 
295 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10992  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1342  Myo-inosose-2 dehydratase  28.21 
 
 
296 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4013  Myo-inosose-2 dehydratase  25.68 
 
 
297 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2255  myo-inositol catabolism protein  25.75 
 
 
298 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1829  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0766527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1675  AP endonuclease  28.57 
 
 
306 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2649  hypothetical protein  28.57 
 
 
306 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0432409  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2968  AP endonuclease  26.33 
 
 
306 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2531  putative IolE protein  25.75 
 
 
298 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32551e-17 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1869  AP endonuclease  26.33 
 
 
350 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2995  Myo-inosose-2 dehydratase  27.5 
 
 
296 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3040  xylose isomerase domain-containing protein  26.33 
 
 
368 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0303  myo-inositol catabolism protein  25.42 
 
 
298 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1324  putative myo-inositol catabolism LolE protein  28.83 
 
 
308 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1596  xylose isomerase domain-containing protein  26.76 
 
 
310 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4706  inosose dehydratase  25.34 
 
 
301 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000727756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4656  xylose isomerase domain-containing protein  26.78 
 
 
298 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3499  iolE protein  27.78 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2299  myo-inositol catabolism protein  25.42 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50050  2-keto-myo-inositol dehydratase  27.17 
 
 
303 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.602375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8495  Myo-inosose-2 dehydratase  28.62 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.795487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3333  Myo-inosose-2 dehydratase  26.16 
 
 
296 aa  99.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5694  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  25.87 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3595  Myo-inosose-2 dehydratase  27.44 
 
 
297 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2811  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  28.11 
 
 
305 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279544  normal  0.182339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5562  Myo-inosose-2 dehydratase  29.29 
 
 
281 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1301  xylose isomerase domain-containing protein  27.08 
 
 
309 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0486  putative myo-inositol catabolism protein  26.09 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal  0.198393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1340  xylose isomerase domain-containing protein  27.08 
 
 
309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.76 
 
 
924 aa  90.1  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0939  xylose isomerase-like TIM barrel  26.74 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00907131  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1421  xylose isomerase domain-containing protein  26.74 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1238  putative myo-inositol catabolism protein  30.61 
 
 
309 aa  89  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2932  xylose isomerase domain-containing protein  27.78 
 
 
308 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.688703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1602  xylose isomerase domain-containing protein  26.71 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3316  xylose isomerase domain-containing protein  26.64 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2835  xylose isomerase domain-containing protein  28.52 
 
 
310 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840707  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1894  xylose isomerase domain-containing protein  26.32 
 
 
309 aa  87  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1399  xylose isomerase domain-containing protein  26.39 
 
 
309 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1577  myo-inositol catabolism protein  25.08 
 
 
298 aa  86.7  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.357804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1133  Myo-inosose-2 dehydratase  27.76 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459716  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3285  sugar phosphate isomerase/epimerase, IolE  25.53 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4017  xylose isomerase domain-containing protein  25.53 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4565  xylose isomerase-like TIM barrel  26.39 
 
 
309 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0833957  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2336  hypothetical protein  28.22 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0067  xylose isomerase domain-containing protein  24.21 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0290166  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2325  xylose isomerase domain-containing protein  28.87 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0980  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  27.4 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1674  xylose isomerase domain-containing protein  26.41 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1912  xylose isomerase domain-containing protein  27.37 
 
 
271 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.193983  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4213  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  26.28 
 
 
340 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0273  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  29.3 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0078  hypothetical protein  23.89 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4190  xylose isomerase-like TIM barrel  24.18 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>