More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1398 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1398  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
435 aa  889    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00269517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2034  histidinol dehydrogenase  79.72 
 
 
435 aa  722    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138079  normal  0.0860001 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6092  histidinol dehydrogenase  55.5 
 
 
436 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0769  histidinol dehydrogenase  56.12 
 
 
437 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1104  histidinol dehydrogenase  48.35 
 
 
441 aa  386  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2242  histidinol dehydrogenase  48.11 
 
 
441 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4290  histidinol dehydrogenase  46.6 
 
 
435 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.682921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4267  histidinol dehydrogenase  47.88 
 
 
436 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02723  hypothetical histidinol dehydrogenase (Eurofung)  47.41 
 
 
438 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.957443  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6970  histidinol dehydrogenase  45.99 
 
 
428 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1517  histidinol dehydrogenase  45.99 
 
 
428 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6312  histidinol dehydrogenase  45.99 
 
 
428 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2498  histidinol dehydrogenase  46.92 
 
 
439 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3579  histidinol dehydrogenase  47.07 
 
 
436 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02554  histidinol dehydrogenase  46.49 
 
 
430 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2545  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 
429 aa  358  7e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7422  histidinol dehydrogenase  44.73 
 
 
437 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0128  histidinol dehydrogenase  48.55 
 
 
444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0166395 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0309  histidinol dehydrogenase  44.1 
 
 
443 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.884454  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1091  histidinol dehydrogenase  44.19 
 
 
435 aa  350  4e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3423  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 
443 aa  346  5e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.542405  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1928  histidinol dehydrogenase  44.5 
 
 
441 aa  343  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1713  histidinol dehydrogenase  44.02 
 
 
432 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810369  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  37.23 
 
 
428 aa  289  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  38.82 
 
 
435 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  37.38 
 
 
433 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  37.01 
 
 
428 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  36.92 
 
 
427 aa  270  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  37.97 
 
 
434 aa  266  5e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  37.8 
 
 
434 aa  266  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  37.44 
 
 
434 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  37.97 
 
 
434 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  35.4 
 
 
429 aa  264  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  38.07 
 
 
434 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  37.71 
 
 
434 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0711798 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  38.07 
 
 
434 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  38.07 
 
 
434 aa  263  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  37.83 
 
 
434 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 
434 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 
434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  37.2 
 
 
434 aa  259  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  34.38 
 
 
424 aa  257  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  36.73 
 
 
434 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0593  histidinol dehydrogenase  38.41 
 
 
434 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  36.73 
 
 
434 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  37.8 
 
 
429 aa  256  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  35.54 
 
 
428 aa  256  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  37.09 
 
 
426 aa  256  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  36.87 
 
 
413 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2178  histidinol dehydrogenase  41.63 
 
 
436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0033  histidinol dehydrogenase  36.56 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000380077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  36.85 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1204  histidinol dehydrogenase  36.56 
 
 
427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  35.85 
 
 
446 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  35.96 
 
 
426 aa  253  7e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  37.12 
 
 
435 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  35.31 
 
 
433 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  35.48 
 
 
431 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  36.1 
 
 
442 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  38.06 
 
 
424 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  37.47 
 
 
436 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  36.99 
 
 
436 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  37.65 
 
 
426 aa  249  8e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  36.61 
 
 
436 aa  249  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 
429 aa  249  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  37.07 
 
 
429 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  36.64 
 
 
442 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  35.19 
 
 
435 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  35.44 
 
 
431 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  35.87 
 
 
429 aa  247  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0891  Histidinol dehydrogenase  35.32 
 
 
426 aa  246  4e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  36.89 
 
 
422 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  36.43 
 
 
424 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 
431 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 
429 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2284  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.253594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  39.29 
 
 
432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  34.71 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0632  histidinol dehydrogenase  36.93 
 
 
434 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  38.74 
 
 
429 aa  244  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  36.17 
 
 
438 aa  243  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1024  histidinol dehydrogenase  35.59 
 
 
439 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal  0.547573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  36.17 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  35.56 
 
 
429 aa  243  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  36.67 
 
 
424 aa  243  6e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  34.13 
 
 
435 aa  243  6e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  37.69 
 
 
445 aa  243  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  35.61 
 
 
434 aa  242  7.999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0979  histidinol dehydrogenase  36.87 
 
 
438 aa  242  9e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.968374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4790  histidinol dehydrogenase  37.16 
 
 
431 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  36.25 
 
 
428 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  35.31 
 
 
429 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3512  histidinol dehydrogenase  36.59 
 
 
431 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  34.47 
 
 
430 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1220  histidinol dehydrogenase  35.73 
 
 
437 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.913588  normal  0.067347 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2771  histidinol dehydrogenase  37.86 
 
 
434 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  35.03 
 
 
867 aa  240  4e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9654  predicted protein  40.63 
 
 
347 aa  240  4e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.971047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  36.19 
 
 
424 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  35.06 
 
 
429 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>