197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1228 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1228  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.181817  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0671  hypothetical protein  57.14 
 
 
246 aa  285  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  decreased coverage  0.00362929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2779  hypothetical protein  56.75 
 
 
240 aa  279  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.196634  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1889  hypothetical protein  55.95 
 
 
246 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0536  hypothetical protein  55.95 
 
 
246 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1913  hypothetical protein  54.51 
 
 
259 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.841584  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1390  hypothetical protein  50.57 
 
 
256 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3076  hypothetical protein  43.58 
 
 
245 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6013  protein of unknown function UPF0005  43.27 
 
 
236 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0713321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  45 
 
 
236 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7161  protein of unknown function UPF0005  43.27 
 
 
236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147509  normal  0.897358 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6220  hypothetical protein  42.5 
 
 
238 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4057  protein of unknown function UPF0005  41 
 
 
242 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3353  hypothetical protein  42.05 
 
 
248 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3734  protein of unknown function UPF0005  41.38 
 
 
242 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2543  protein of unknown function UPF0005  43.08 
 
 
255 aa  175  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.0807809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2225  protein of unknown function UPF0005  42.69 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0352825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  43.21 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0088  hypothetical protein  41.38 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3093  integral membrane protein  46.12 
 
 
237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.718082  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3820  hypothetical protein  46.12 
 
 
237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0086  hypothetical protein  41.38 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1019  hypothetical protein  41.57 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.219255  normal  0.241296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  39.06 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4182  hypothetical protein  40.45 
 
 
256 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.253743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3558  hypothetical protein  44.98 
 
 
250 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0001  hypothetical protein  39.85 
 
 
257 aa  169  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3673  hypothetical protein  45.71 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.915645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5468  hypothetical protein  42.59 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.328597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1779  protein of unknown function UPF0005  42.21 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0100  hypothetical protein  40.81 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1395  hypothetical protein  42.59 
 
 
252 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.681625  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2043  hypothetical protein  41.51 
 
 
261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.28558  normal  0.977268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1912  protein of unknown function UPF0005  40.31 
 
 
261 aa  155  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.224132 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1143  hypothetical protein  40.41 
 
 
247 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2268  hypothetical protein  43.7 
 
 
294 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0287  hypothetical protein  42.47 
 
 
263 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0137467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0529  hypothetical protein  41.09 
 
 
263 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0551  hypothetical protein  42.32 
 
 
271 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0413  hypothetical protein  42.69 
 
 
263 aa  151  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229598  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0260  protein of unknown function UPF0005  38.55 
 
 
259 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0529527  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3668  hypothetical protein  38.24 
 
 
244 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.16725  hitchhiker  0.0000130091 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0050  putative membrane proetin  34.69 
 
 
251 aa  150  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2518  protein of unknown function UPF0005  37.55 
 
 
236 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0945287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0849  hypothetical protein  42.74 
 
 
242 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.890327  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0200  hypothetical protein  41.6 
 
 
271 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1517  hypothetical protein  37.3 
 
 
235 aa  148  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0386  putative transport protein  39.77 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0901  inner membrane protein YbhL  37.86 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0956  inner membrane protein YbhL  37.86 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0870  membrane protein  37.86 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484875  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0842  inner membrane protein YbhL  37.86 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2947  protein of unknown function UPF0005  37.7 
 
 
235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0828  hypothetical protein  41.5 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0813  hypothetical protein  40.59 
 
 
242 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0875239  hitchhiker  0.00101032 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1278  hypothetical protein  38.24 
 
 
235 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.278652  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2427  protein of unknown function UPF0005  38.53 
 
 
236 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0809  hypothetical protein  36.63 
 
 
234 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00257878  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00753  predicted inner membrane protein  37.04 
 
 
234 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2856  protein of unknown function UPF0005  37.04 
 
 
234 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0840  hypothetical protein  37.04 
 
 
234 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2566  hypothetical protein  37.04 
 
 
234 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0849  hypothetical protein  37.04 
 
 
234 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2857  hypothetical protein  37.04 
 
 
234 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496163 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00770  hypothetical protein  37.04 
 
 
234 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1325  hypothetical protein  36.69 
 
 
236 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2918  hypothetical protein  37.07 
 
 
236 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.117943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2832  hypothetical protein  37.07 
 
 
236 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.448865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0933  hypothetical protein  37.34 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1438  hypothetical protein  36.64 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0934  hypothetical protein  36.63 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  38.6 
 
 
234 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0937  hypothetical protein  34.92 
 
 
234 aa  138  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419647  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5385  hypothetical protein  36.55 
 
 
241 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0009  hypothetical protein  36.36 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  unclonable  0.0000179437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4993  hypothetical protein  37.21 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2081  protein of unknown function UPF0005  37.15 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0430200000000002e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2135  protein of unknown function UPF0005  36.9 
 
 
224 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000126881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1173  protein of unknown function UPF0005  37.35 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00047203  normal  0.359337 
 
 
-
 
NC_002978  WD0950  hypothetical protein  35.42 
 
 
240 aa  132  6e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.816971  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6925  hypothetical protein  37.34 
 
 
239 aa  131  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2601  membrane protein, putaive  34.16 
 
 
233 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  37.5 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  35.11 
 
 
232 aa  126  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  34.02 
 
 
235 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0927  protein of unknown function UPF0005  34.62 
 
 
235 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.441127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0772  hypothetical protein  33.75 
 
 
233 aa  121  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.768217  normal  0.283665 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0129  hypothetical protein  35.69 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.576127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0912  hypothetical protein  35.4 
 
 
232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.409421  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3162  protein of unknown function UPF0005  34.21 
 
 
234 aa  115  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1437  protein of unknown function UPF0005  34.08 
 
 
219 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0272  membrane protein  34.13 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000292393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4095  protein of unknown function UPF0005  33.47 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0302  hypothetical protein  33.47 
 
 
234 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171893  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4126  protein of unknown function UPF0005  33.06 
 
 
236 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  34.51 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3983  hypothetical protein  33.06 
 
 
236 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2911  hypothetical protein  33.86 
 
 
254 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1882  integral membrane protein  34.98 
 
 
239 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.302191  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0308  hypothetical protein  34.98 
 
 
239 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>