More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1162 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  100 
 
 		 398 aa  818    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  76.96 
 
 		 422 aa  636    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  63.96 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  65.12 
 
 		 406 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  65.12 
 
 		 406 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  63.12 
 
 		 401 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  64.54 
 
 		 406 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  63.05 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  62.6 
 
 		 391 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  63.4 
 
 		 398 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  62.6 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  62.94 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  61.68 
 
 		 406 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  60.73 
 
 		 401 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  58.21 
 
 		 395 aa  478  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  62.53 
 
 		 402 aa  478  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  60.97 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  62.2 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  60.41 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  61.26 
 
 		 406 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  60.98 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  57.97 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  60.31 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  54.71 
 
 		 399 aa  451  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  59.22 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  55.24 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  59.22 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  53.98 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  48.09 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  49.87 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  49.87 
 
 		 417 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  48.59 
 
 		 402 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  47.86 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  50.13 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  48.08 
 
 		 402 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  47.83 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  48.7 
 
 		 421 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  47.33 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  45.72 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  45.84 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  44.77 
 
 		 391 aa  325  6e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  45.87 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  45.29 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  43.28 
 
 		 391 aa  319  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  42.74 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  45.04 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  42.47 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  44.35 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  43.02 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  39.12 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  38.13 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  37.56 
 
 		 395 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  37.82 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  40.16 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  39.43 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  39.43 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  37.87 
 
 		 385 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  40 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  35.25 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  35.25 
 
 		 384 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.48 
 
 		 382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.01 
 
 		 387 aa  252  7e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  36.81 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  37.67 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.36 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  36.09 
 
 		 387 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  36.22 
 
 		 382 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.22 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  35.7 
 
 		 382 aa  242  9e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  35.53 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  38.42 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  34.46 
 
 		 382 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  36.27 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 396 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  38.34 
 
 		 385 aa  238  9e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  40.87 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  35.75 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  36.13 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.29 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.75 
 
 		 387 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  35.91 
 
 		 404 aa  235  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  36.01 
 
 		 385 aa  235  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.36 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  35.96 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.36 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  37.53 
 
 		 382 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.81 
 
 		 362 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  34.29 
 
 		 386 aa  232  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  38.54 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  40.31 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  38.02 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  40.05 
 
 		 400 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  35.08 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  37.87 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  34.03 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0729  aminotransferase, class V  38.42 
 
 		 390 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.434547  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  34.26 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.03 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  34.55 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  35.42 
 
 		 380 aa  222  8e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>