More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1084 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  66.25 
 
 
554 aa  727    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  72.66 
 
 
554 aa  789    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  66.25 
 
 
554 aa  727    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  63.54 
 
 
554 aa  711    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 
556 aa  1088    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  66.61 
 
 
554 aa  734    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  66.13 
 
 
554 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  51.58 
 
 
535 aa  507  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  50.35 
 
 
533 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  48.76 
 
 
532 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  48.94 
 
 
533 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  49.82 
 
 
534 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  48.58 
 
 
533 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  49.65 
 
 
533 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  49.82 
 
 
533 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  46.98 
 
 
535 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.99 
 
 
856 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  47.08 
 
 
531 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  45.82 
 
 
534 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  46.18 
 
 
534 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  47.41 
 
 
532 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  45.62 
 
 
534 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.74 
 
 
856 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  43.76 
 
 
533 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.26 
 
 
853 aa  432  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  43.12 
 
 
532 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  43.12 
 
 
532 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.47 
 
 
849 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.41 
 
 
839 aa  408  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.58 
 
 
848 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  43.97 
 
 
551 aa  404  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  41.64 
 
 
531 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  41.18 
 
 
532 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.6 
 
 
845 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.62 
 
 
844 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.41 
 
 
844 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  44.09 
 
 
535 aa  385  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  42.73 
 
 
537 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.95 
 
 
844 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  38.12 
 
 
843 aa  361  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.29 
 
 
525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.96 
 
 
533 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.35 
 
 
530 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  41.6 
 
 
501 aa  349  9e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  40.19 
 
 
533 aa  346  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  39.16 
 
 
532 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  39.43 
 
 
532 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  40.12 
 
 
508 aa  344  2e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  40.33 
 
 
505 aa  344  2e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.02 
 
 
834 aa  343  5e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  40.04 
 
 
632 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  38.62 
 
 
533 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  39.17 
 
 
632 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  39.17 
 
 
632 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  38.43 
 
 
533 aa  333  6e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  38.52 
 
 
625 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.53 
 
 
846 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  38.28 
 
 
530 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.89 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.89 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.72 
 
 
846 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  38.9 
 
 
521 aa  320  6e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  39.36 
 
 
529 aa  320  6e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  33.91 
 
 
640 aa  319  9e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  37.3 
 
 
621 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  37.62 
 
 
614 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  40.48 
 
 
533 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  37.8 
 
 
522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  40.53 
 
 
502 aa  313  5.999999999999999e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  39.96 
 
 
533 aa  313  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  39.49 
 
 
636 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  38.26 
 
 
526 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  39.92 
 
 
626 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  38.14 
 
 
621 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  38.78 
 
 
530 aa  310  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  37.28 
 
 
626 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  36.84 
 
 
534 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  39.12 
 
 
532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  32.85 
 
 
627 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  36.7 
 
 
626 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  39.42 
 
 
618 aa  306  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  39.21 
 
 
524 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.54 
 
 
531 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  38.92 
 
 
526 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  39.46 
 
 
604 aa  302  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2645  preprotein translocase subunit SecD  38.36 
 
 
616 aa  302  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00285631  hitchhiker  0.000483823 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  38.52 
 
 
521 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  36.56 
 
 
526 aa  301  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  37.69 
 
 
633 aa  301  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  37.33 
 
 
681 aa  300  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1407  secretion protein SecD  36.81 
 
 
622 aa  301  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0970542  normal  0.495357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  37.8 
 
 
535 aa  300  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  38.97 
 
 
510 aa  298  1e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  43.96 
 
 
473 aa  296  6e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  34.46 
 
 
616 aa  296  7e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2946  preprotein translocase subunit SecD  38.61 
 
 
621 aa  296  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  37.26 
 
 
609 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  37.18 
 
 
532 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  39.09 
 
 
618 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  36.68 
 
 
512 aa  294  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>