More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1053 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1053  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
342 aa  700    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3823  ribose-phosphate pyrophosphokinase  79.04 
 
 
339 aa  559  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0976  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.04 
 
 
339 aa  554  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.508643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2301  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  78.04 
 
 
339 aa  554  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2199  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.04 
 
 
339 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2931  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.4 
 
 
340 aa  547  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.134005  normal  0.0220495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.71 
 
 
340 aa  542  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344649  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1709  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.44 
 
 
310 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347929  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2258  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 
311 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.284821  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  60.25 
 
 
310 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3026  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.04 
 
 
310 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.695746  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 
317 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0971  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.86 
 
 
311 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4846  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 
317 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.81 
 
 
314 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 
310 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2763  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 
310 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0549676  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2553  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.36 
 
 
317 aa  368  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.391347  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 
310 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1487  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 
314 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3177  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.41 
 
 
310 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.36 
 
 
310 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2501  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.04 
 
 
331 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.81 
 
 
314 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.81 
 
 
314 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6074  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.18 
 
 
316 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.81 
 
 
346 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1409  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.36 
 
 
317 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70704  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.04 
 
 
317 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.04 
 
 
310 aa  362  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3879  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.62 
 
 
317 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.409064  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4168  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.04 
 
 
317 aa  362  6e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384244  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2942  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.12 
 
 
311 aa  361  8e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2438  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.12 
 
 
311 aa  361  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.167005  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0671  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.75 
 
 
312 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.73 
 
 
328 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.73 
 
 
310 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0645  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.21 
 
 
310 aa  359  4e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.78 
 
 
310 aa  358  7e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0838998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.99 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.550032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
310 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1089  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.17 
 
 
326 aa  352  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  54.75 
 
 
312 aa  347  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
310 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.973686  normal  0.13758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.17 
 
 
315 aa  345  5e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0722  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
313 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162348  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
310 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0756  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
310 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4461  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
310 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.329466  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1104  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.75 
 
 
313 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0514  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.01 
 
 
336 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3627  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.7 
 
 
316 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.56 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.18 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.18 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41520  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
313 aa  342  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.684903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0944  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
313 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
310 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00928462  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2766  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.28 
 
 
315 aa  341  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.244437  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2385  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.28 
 
 
315 aa  341  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.90823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
324 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2813  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.38 
 
 
320 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223011  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2188  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.38 
 
 
320 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0141666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2802  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.38 
 
 
320 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.94 
 
 
316 aa  340  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1208  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.63 
 
 
317 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.511397 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 
321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  54.57 
 
 
321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3610  Fis family transcriptional regulator  53.37 
 
 
319 aa  339  5e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.493844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.09 
 
 
315 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.015709  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0513  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.01 
 
 
318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127422  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0172  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.77 
 
 
315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2365  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.17 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.870749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2862  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
320 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000366656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.06 
 
 
319 aa  335  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5320  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
313 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61770  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
313 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.701218  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.33 
 
 
317 aa  335  5e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.09 
 
 
318 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3120  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.205277  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0088  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0527  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.15 
 
 
312 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0753  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0569  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00937686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.882389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1502  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00100657  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
318 aa  335  7e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.014212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2720  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.11 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000418106  normal  0.234705 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6132  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.43 
 
 
320 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000299156  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.09 
 
 
318 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.7 
 
 
324 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.94 
 
 
316 aa  334  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0759  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.31 
 
 
310 aa  334  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.03 
 
 
316 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0607  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
315 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.57 
 
 
321 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0588  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.84 
 
 
315 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0951  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.76 
 
 
324 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>