More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0975 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  100 
 
 
445 aa  893  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  72.97 
 
 
444 aa  622  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  72.73 
 
 
444 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  72.73 
 
 
444 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  68.85 
 
 
446 aa  613  1e-174  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  66.14 
 
 
441 aa  582  1e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  62.41 
 
 
461 aa  548  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  51.24 
 
 
450 aa  447  1e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  52.83 
 
 
444 aa  441  1e-122  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  52.25 
 
 
449 aa  439  1e-122  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  50.93 
 
 
446 aa  439  1e-122  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  49.89 
 
 
450 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  52.53 
 
 
443 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  51.3 
 
 
449 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  53.38 
 
 
450 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  52.77 
 
 
443 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  51.02 
 
 
436 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  52.42 
 
 
443 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  52.29 
 
 
443 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  49.1 
 
 
450 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  52.54 
 
 
441 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  50.33 
 
 
439 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  50.36 
 
 
462 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  48.18 
 
 
435 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3200  translocation protein TolB  48.64 
 
 
435 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3495  translocation protein TolB  51.58 
 
 
435 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.594815  normal  0.174219 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0144  translocation protein TolB  46.76 
 
 
442 aa  392  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  48.22 
 
 
439 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  47.54 
 
 
448 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  43.62 
 
 
453 aa  357  3e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  47.92 
 
 
442 aa  353  3e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  47.06 
 
 
442 aa  349  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  42.54 
 
 
469 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  2.01302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  47.24 
 
 
451 aa  346  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  47.4 
 
 
454 aa  343  3e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  45.56 
 
 
446 aa  333  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  43.53 
 
 
461 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  45.08 
 
 
446 aa  330  3e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  45.08 
 
 
446 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  43.91 
 
 
462 aa  329  6e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  43.75 
 
 
445 aa  329  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  37.21 
 
 
450 aa  284  2e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  37.37 
 
 
420 aa  277  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  34.45 
 
 
415 aa  234  2e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.1462e-08  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  34.06 
 
 
434 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  36.95 
 
 
443 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.71 
 
 
422 aa  223  5e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  34.71 
 
 
422 aa  223  5e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  34.73 
 
 
435 aa  221  2e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  4.01957e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  31.81 
 
 
432 aa  220  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  35.48 
 
 
441 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.56 
 
 
457 aa  217  3e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  33.41 
 
 
427 aa  216  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.81605e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  31.44 
 
 
442 aa  213  6e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  33.48 
 
 
429 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.18 
 
 
421 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32.12 
 
 
428 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  32.73 
 
 
426 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  33.71 
 
 
441 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.93 
 
 
428 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  32.44 
 
 
425 aa  207  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  30.82 
 
 
451 aa  206  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  34.05 
 
 
438 aa  206  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  32.85 
 
 
432 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  33.03 
 
 
443 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  31.39 
 
 
428 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  33.49 
 
 
446 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.82 
 
 
430 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.51 
 
 
450 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.34537e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2529  translocation protein TolB  31.64 
 
 
445 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.20948e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  31.66 
 
 
439 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  33.82 
 
 
424 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  32.94 
 
 
435 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  30.75 
 
 
436 aa  201  2e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  32.27 
 
 
439 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  32.23 
 
 
419 aa  200  4e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  32.69 
 
 
440 aa  199  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  33.09 
 
 
414 aa  199  1e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1415  translocation protein TolB  33.25 
 
 
433 aa  198  2e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00100672  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  31.99 
 
 
419 aa  198  2e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  32.37 
 
 
437 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  30.14 
 
 
427 aa  197  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3972  tolB protein  33.25 
 
 
433 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956227  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  32.12 
 
 
439 aa  197  4e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  31.57 
 
 
441 aa  196  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.40509e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.79 
 
 
442 aa  196  8e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  34.46 
 
 
430 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  31.96 
 
 
421 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.72 
 
 
434 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  35.17 
 
 
425 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  31.82 
 
 
450 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.23 
 
 
434 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  32.7 
 
 
408 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  32.27 
 
 
474 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.78 
 
 
407 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  36.02 
 
 
429 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.0948e-15  normal 
 
 
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  32.3 
 
 
437 aa  192  9e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  32.3 
 
 
440 aa  192  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.48 
 
 
442 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.03609e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  31.96 
 
 
423 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>