More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0971 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 137 aa  269  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  70.9 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  70.07 
 
 		 162 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  72.13 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  72.13 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.31 
 
 		 156 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.43 
 
 		 154 aa  176  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  60.33 
 
 		 150 aa  146  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  60.33 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  60.33 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.98 
 
 		 144 aa  143  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.16 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  57.02 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  55.74 
 
 		 152 aa  133  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.65 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  56.56 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  56.56 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  52.42 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  54.55 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  53.54 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.61 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.79 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  52.5 
 
 		 145 aa  120  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.61 
 
 		 151 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  51.67 
 
 		 147 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  45.58 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  49.17 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  45.6 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  48.33 
 
 		 148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5229  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.334933  normal  0.0672636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4762  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.718124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.84 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5304  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.5 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159444  normal  0.423662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  45.6 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  46.4 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  42.28 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  45.6 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  48.8 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  41.98 
 
 		 146 aa  111  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.4 
 
 		 150 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  40.65 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  48.31 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  48.33 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.15 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.15 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.24 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.44 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  44.17 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.26 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  40.16 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.34 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.17 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1132  TonB system transport protein ExbD  49.58 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  50.41 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0921  biopolymer transport protein, ExbD  50 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.284427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  42.4 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  45.76 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  42.86 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.4 
 
 		 173 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  46.22 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  44.92 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  43.09 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  45.76 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  46.22 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.26 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.17 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1308  biopolymer transport exbD protein  43.9 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.47684  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  42.19 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  45.38 
 
 		 142 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  40.98 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  49.18 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  49.15 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  43.33 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  40.31 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  44.92 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  45.38 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.16 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  45.76 
 
 		 169 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.16 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  42.5 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  42.5 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  46.61 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3630  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.46 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  42.5 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04990  TolR-like protein  41.79 
 
 		 147 aa  98.2  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0118688  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  42.5 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  44.54 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.9 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1268  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.8 
 
 		 156 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0930334  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  43.33 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2306  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.8 
 
 		 156 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.426715  normal  0.290697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  45.76 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1516  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.890263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 154 aa  97.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>