More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0890 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  100 
 
 
388 aa  734    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  45.77 
 
 
414 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26110  putative MFS transporter  51.28 
 
 
392 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.463026 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  46.13 
 
 
394 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0640  major facilitator superfamily MFS_1  48.16 
 
 
395 aa  259  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403686  normal  0.404462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1617  major facilitator family transporter  49.57 
 
 
405 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3762  major facilitator transporter  48.47 
 
 
400 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147545  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3708  major facilitator transporter  44.68 
 
 
386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2421  major facilitator transporter  45.1 
 
 
384 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2688  major facilitator family transporter  45.1 
 
 
384 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4299  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 
391 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
415 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0867  major facilitator transporter  34.92 
 
 
391 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  37.36 
 
 
405 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.93 
 
 
415 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  34.07 
 
 
400 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  34.53 
 
 
400 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  35.57 
 
 
409 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  36.31 
 
 
389 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  33.43 
 
 
400 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  33.15 
 
 
400 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  32.87 
 
 
391 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  34.44 
 
 
396 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  31.9 
 
 
400 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  32.96 
 
 
391 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  35.52 
 
 
394 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  32.41 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  34.36 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  32.41 
 
 
391 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  32.87 
 
 
400 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  32.87 
 
 
400 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  33.81 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.69 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  34.84 
 
 
391 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  32.41 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  34.59 
 
 
390 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 
406 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  36.39 
 
 
406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 
407 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.44 
 
 
391 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 
391 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  33.84 
 
 
401 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  34.99 
 
 
387 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  32.66 
 
 
391 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
388 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  34.56 
 
 
391 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  35.52 
 
 
403 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 
388 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.33 
 
 
392 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.08 
 
 
391 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  35.51 
 
 
407 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  30.81 
 
 
408 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.8 
 
 
391 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  30.9 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 
388 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
404 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.77 
 
 
391 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  30.9 
 
 
404 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  30.9 
 
 
404 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.66 
 
 
388 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  33.63 
 
 
384 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.57 
 
 
399 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  32.04 
 
 
398 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  35.05 
 
 
400 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  35.17 
 
 
388 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  35.47 
 
 
388 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  34.47 
 
 
390 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  32.89 
 
 
389 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.06 
 
 
391 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  32.97 
 
 
397 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
422 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  33.78 
 
 
396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.21 
 
 
400 aa  152  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  33.71 
 
 
388 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  33.7 
 
 
412 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  33.71 
 
 
388 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.92 
 
 
416 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  32.56 
 
 
397 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  33.62 
 
 
403 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  33.14 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  33.14 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  33.14 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  33.14 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  30.62 
 
 
404 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  33.14 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  31.92 
 
 
391 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.34 
 
 
415 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  33.14 
 
 
390 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 
409 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  33.14 
 
 
390 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  33.63 
 
 
422 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  30.34 
 
 
415 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  33.05 
 
 
389 aa  149  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.34 
 
 
404 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  33.53 
 
 
386 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>