More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0880 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0880  ROK  100 
 
 
403 aa  804    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  51.13 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  41.67 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  44.62 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  44.24 
 
 
393 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  39.9 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  42.78 
 
 
393 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  36.13 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.68 
 
 
420 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  36.42 
 
 
400 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  35.48 
 
 
373 aa  160  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.2 
 
 
392 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  34.12 
 
 
332 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  31.81 
 
 
404 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  31.38 
 
 
386 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  28.08 
 
 
381 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.02 
 
 
409 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.55 
 
 
395 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.69 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  31.3 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  32.91 
 
 
387 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  29.71 
 
 
387 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  34.15 
 
 
391 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  31.55 
 
 
393 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.27 
 
 
391 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  33.94 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  30.53 
 
 
392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.12 
 
 
418 aa  133  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.65 
 
 
395 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.22 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  30.87 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.82 
 
 
417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.85 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.63 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  30.96 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.16 
 
 
323 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  33.06 
 
 
415 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.57 
 
 
387 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  30.13 
 
 
398 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.42 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  28.72 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.42 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.92 
 
 
317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  30.65 
 
 
503 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  31 
 
 
408 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.84 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.83 
 
 
429 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  25.85 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  32.79 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  36.47 
 
 
383 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  31.09 
 
 
390 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.41 
 
 
396 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.94 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  30.91 
 
 
401 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.66 
 
 
332 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.25 
 
 
380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.92 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.21 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.5 
 
 
378 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.42 
 
 
389 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  28.09 
 
 
292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  31.27 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.35 
 
 
401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.54 
 
 
313 aa  113  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.74 
 
 
315 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.74 
 
 
315 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  24.93 
 
 
405 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  29.71 
 
 
448 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  29.26 
 
 
321 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  28.79 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.36 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  37.55 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  30.07 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  28.26 
 
 
754 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.39 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.79 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  28.39 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  27.04 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  31.61 
 
 
390 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.43 
 
 
347 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.33 
 
 
406 aa  111  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.2 
 
 
381 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  28.24 
 
 
404 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  31.03 
 
 
402 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  29.13 
 
 
407 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  29.68 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  29.82 
 
 
321 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28.66 
 
 
402 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.2 
 
 
410 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  27.79 
 
 
391 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  32.8 
 
 
417 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.33 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  27.71 
 
 
416 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.35 
 
 
383 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.33 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.33 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.65 
 
 
404 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.33 
 
 
406 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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