16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0854 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0854  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  875    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  26.81 
 
 		 643 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0108  hypothetical protein  24.59 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713971  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  26.67 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  27.72 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  27.72 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  27.72 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  25.71 
 
 		 485 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  26.63 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  26.11 
 
 		 481 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  26.11 
 
 		 481 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  22.91 
 
 		 482 aa  48.5  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  23.98 
 
 		 493 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  22.43 
 
 		 634 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  21.53 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  20.92 
 
 		 514 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>