168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0798 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0798  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  100 
 
 
119 aa  246  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.835916  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4229  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  52.83 
 
 
108 aa  113  1e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.289876  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4385  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.54 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0118502  normal  0.891502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1024  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  45.16 
 
 
105 aa  90.1  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0737742  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1517  HNS family histone-like protein  44.55 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2782  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  46.23 
 
 
102 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0983316  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0169  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  44.55 
 
 
104 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2961  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  43.56 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0570093 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4162  hypothetical protein  40.59 
 
 
247 aa  83.2  1e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4056  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  40.59 
 
 
105 aa  82  2e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4136  hypothetical protein  42.57 
 
 
132 aa  81.3  5e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1545  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.61 
 
 
105 aa  80.9  5e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  0.0365604 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3107  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  39.62 
 
 
106 aa  74.7  4e-13  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1986  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.5 
 
 
105 aa  74.7  4e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  1.14439e-07  normal  0.0153833 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7372  H-NS family DNA-binding protein  34.65 
 
 
104 aa  72.8  2e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1957  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30.89 
 
 
121 aa  71.6  3e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00140882  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0439  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.27 
 
 
107 aa  70.5  7e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  3.52276e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0441  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  38.6 
 
 
124 aa  68.6  3e-11  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.940607  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3349  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.16 
 
 
105 aa  68.6  3e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2525  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  32.04 
 
 
105 aa  68.6  3e-11  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.16284e-21  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1370  nucleoid protein H-NS  35.58 
 
 
115 aa  64.3  5e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.620152  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3156  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  42.16 
 
 
105 aa  62.4  2e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116532  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03185  DNA-binding protein  30.33 
 
 
153 aa  58.5  3e-08  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1489  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.04 
 
 
115 aa  57  9e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3068  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  34.26 
 
 
122 aa  57  9e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.280777  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2060  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  37.76 
 
 
91 aa  56.6  1e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3069  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  26.72 
 
 
130 aa  55.8  2e-07  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.39515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1150  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
99 aa  55.8  2e-07  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2738  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.33 
 
 
139 aa  55.1  3e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.63 
 
 
91 aa  53.9  7e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.222409  normal  0.184824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4128  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.17 
 
 
95 aa  53.5  1e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382519  hitchhiker  5.10411e-09 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2290  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.69 
 
 
112 aa  52.8  1e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1913  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.17 
 
 
95 aa  53.5  1e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83319e-09 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1651  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  41.51 
 
 
107 aa  53.1  1e-06  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1793  DNA-binding protein  32.93 
 
 
124 aa  52.8  2e-06  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1726  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.93 
 
 
124 aa  52.4  2e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.442577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3562  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.9 
 
 
139 aa  52.4  2e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.626821  normal  0.684238 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0019  H-NS histone family  36.9 
 
 
141 aa  51.6  3e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2158  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.23 
 
 
96 aa  51.6  4e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.811955 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1863  regulator protein, putative  32 
 
 
112 aa  51.2  5e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  3.71113e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0838  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.94 
 
 
94 aa  50.8  7e-06  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4700  DNA-binding protein  30.91 
 
 
144 aa  50.4  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3677  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  30 
 
 
102 aa  50.4  8e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2714  DNA-binding protein BprA  29.25 
 
 
111 aa  50.1  1e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344106  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02604  putative HNS-like transcription regulator protein  30 
 
 
102 aa  50.1  1e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00414449  normal  0.0842767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0048  H-NS histone family protein  33.66 
 
 
125 aa  49.7  1e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3387  DNA-binding protein H-NS-like protein  30.91 
 
 
144 aa  50.1  1e-05  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5596  nucleoid protein H-NS  29.13 
 
 
102 aa  50.1  1e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.16143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2905  H-NS histone family protein  33.66 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1636  H-NS histone family protein  33.66 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3404  H-NS histone family protein  33.66 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237819  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2911  hypothetical protein  47.83 
 
 
92 aa  48.9  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2580  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.99 
 
 
119 aa  49.3  2e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.122678  normal  0.024514 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0526  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  31.2 
 
 
127 aa  48.9  2e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3155  H-NS histone family protein  33.66 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1152  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.36 
 
 
133 aa  49.3  2e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2575  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.36 
 
 
133 aa  49.3  2e-05  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3827  H-NS histone family protein  33.66 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3909  H-NS histone family protein  33.66 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2965  H-NS histone family protein  33.66 
 
 
97 aa  49.3  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1968  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  35.44 
 
 
93 aa  49.3  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01827  hypothetical protein  43.4 
 
 
135 aa  48.5  3e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0002  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  27.34 
 
 
131 aa  48.5  3e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0049965  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2825  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.01 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3384  histone-like nucleoid-structuring protein H-NS  33.01 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3595  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.76 
 
 
95 aa  48.1  4e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.137974  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0263  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.01 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0281  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.01 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3476  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634664  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4070  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.76 
 
 
95 aa  48.1  5e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000676326  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1795  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  57.14 
 
 
114 aa  47.8  5e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0867  putative HNS-like transcription regulator protein  28.43 
 
 
96 aa  47.8  5e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.139885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4238  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 
102 aa  47.8  6e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4348  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.77 
 
 
102 aa  47.8  6e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.513312 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0190  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  33.01 
 
 
97 aa  47  8e-05  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317548  hitchhiker  1.90695e-08 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1065  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.55 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4934  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  39.68 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1144  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  29.55 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439674  normal  0.582774 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0700  DNA-binding protein VicH  35.9 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1136  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.69 
 
 
104 aa  47  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00265311  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2145  DNA binding protein, global metabolism regulator  31.25 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4465  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.53 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.695514  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2842  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30.97 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00137778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2605  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  34.67 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.730726  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7379  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  36.71 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  8.93778e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0209  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.67 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.726678 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4633  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  30 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  2.92632e-13  decreased coverage  2.43295e-05 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0195  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.67 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0787  DNA-binding protein H-NS  30.77 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.123185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003852  DNA-binding protein H-NS  33.33 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0195644  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4886  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  28.95 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.602991  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02489  hypothetical protein  35.21 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3212  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1037  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2949  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3911  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.268261 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3146  H-NS family DNA-binding protein  30.51 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2975  putative H-NS-like transcription regulator  32.67 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2789  DNA binding protein, nucleoid-associated  35.21 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.338985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4071  histone family protein nucleoid-structuring protein H-NS  32.53 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0737815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>