More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0722 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0722  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  583  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5946  transcriptional regulator LysR family  36.91 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0386  transcriptional regulator, LysR family  34.8 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2289  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3368  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4568  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.759587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3832  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.524021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1371  LysR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3977  transcriptional regulatory protein  32.53 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3293  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185242  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0840  LysR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3834  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.92 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1135  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 299 aa  149  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0556811  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0148  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.148101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0372  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103497  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5859  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1039  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0977  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0359  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0121795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0343  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 313 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.294854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2194  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2725  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0881  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2895  LysR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521914  normal  0.0431936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2844  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.223887  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3779  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.750193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2031  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.810813  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3476  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 319 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2367  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4317  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4049  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 319 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0950657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2769  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4928  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 307 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3974  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 328 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.140467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3052  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 292 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1860  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0547107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2478  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.585884  normal  0.517095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4731  helix-turn-helix, Fis-type  31.85 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210244  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2863  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.753001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7356  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3189  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4767  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4279  LysR substrate-binding  33.56 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4540  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0590293  normal  0.826937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0126  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4796  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.87125 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5018  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.448472 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3448  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7466  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2242  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163141  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3188  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.708036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4291  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4075  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0242  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 318 aa  125  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3951  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.358181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4666  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  0.172024 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2474  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.790384  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3444  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0825  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4532  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176427  normal  0.951111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4668  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 316 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0173  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0103543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1335  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 290 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1036  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1833  LysR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 301 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.386292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0766  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 338 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2973  putative transcriptional regulator  34.89 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4646  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0173  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1632  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1259  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3045  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 297 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.54605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3295  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3156  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1705  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.95 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1766  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1067  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 293 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3421  LysR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5300  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.233752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0694  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4514  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.973008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5209  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 349 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405506  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2886  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0958949  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6740  transcriptional regulator, LysR family  26.83 
 
 		 317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3487  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.475425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0323  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0781  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0412  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 319 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0071  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000017949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33750  LysR family transcriptional regulator protein  30.99 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5824  transcriptional regulator, LysR family  27.53 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5348  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35250  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.587508 
 
 
-
 
NC_003296  RS01990  transcriptional regulator transcription regulator protein  32.54 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5961  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2523  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1792  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>