More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0623 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
105 aa  199  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  75.27 
 
 
109 aa  124  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  72.53 
 
 
154 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  61.54 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  61.54 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  54.35 
 
 
124 aa  88.2  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  53.12 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  48.94 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  52.13 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  48.15 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  45.19 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  52.13 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  49.48 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  46.74 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  47.13 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  49.46 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  48.94 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  43.53 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  50.55 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  48.39 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  47.78 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  46.67 
 
 
123 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  45.74 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.66 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  43.16 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  51.76 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  47.96 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  47.42 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  38.38 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  38.38 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  46.25 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  51.76 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  37.89 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  51.76 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  44.33 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.04 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 
124 aa  62  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  48.75 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  34.23 
 
 
128 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 
124 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  42.68 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  48.61 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  39.58 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 
124 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  44.19 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  40 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  39.36 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  45.45 
 
 
126 aa  58.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  39.56 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  41.86 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  48.78 
 
 
125 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  46.25 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  37.63 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.76 
 
 
133 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  40 
 
 
118 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  38.55 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  31.13 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  38.95 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.76 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  48.65 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  35.42 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  33.98 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.3 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.66 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  35.35 
 
 
122 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 
124 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0149  crcB protein  50.59 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  42.39 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.18 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.74 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.95 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  39.08 
 
 
124 aa  52.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  41.3 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.83 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  41.3 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  45.59 
 
 
270 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  38.3 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  46.15 
 
 
131 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  41.67 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>