More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0616 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
129 aa  263  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  88.37 
 
 
129 aa  238  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  86.82 
 
 
129 aa  236  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  87.6 
 
 
129 aa  236  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  75.97 
 
 
129 aa  210  7e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 
129 aa  204  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  75.19 
 
 
129 aa  203  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  74.42 
 
 
129 aa  201  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  74.42 
 
 
129 aa  201  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  74.42 
 
 
129 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  73.64 
 
 
129 aa  199  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 
129 aa  199  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  199  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 
129 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  81.03 
 
 
129 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 
130 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  197  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 
129 aa  196  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  196  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  196  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  196  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 
129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1738  30S ribosomal protein S11  86.82 
 
 
129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0384  30S ribosomal protein S11  86.82 
 
 
129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226063  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 
129 aa  194  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2511  30S ribosomal protein S11  86.05 
 
 
129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  70.97 
 
 
130 aa  189  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  68.03 
 
 
132 aa  181  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  68.03 
 
 
133 aa  181  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  68.8 
 
 
128 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 
131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 
129 aa  180  7e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 
129 aa  180  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 
129 aa  180  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 
131 aa  179  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 
131 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 
133 aa  179  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
129 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  66.39 
 
 
133 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  66.39 
 
 
133 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  66.39 
 
 
133 aa  176  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
134 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 
130 aa  175  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4775  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  65.57 
 
 
135 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
134 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
134 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 
133 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 
131 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 
134 aa  174  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 
129 aa  173  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
127 aa  173  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
129 aa  173  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
129 aa  173  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 
131 aa  173  9e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0721  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 
129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.103667  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
134 aa  172  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2456  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2178  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 
130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 
130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 
130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 
129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  64.71 
 
 
135 aa  171  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
134 aa  170  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
134 aa  170  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
134 aa  170  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
134 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
134 aa  170  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>